RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527026.1

PTPRJ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRJ, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-204ENST00000527026 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRJ-204ENST00000527026 PRDM2Q13029 1718 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRJ-204ENST00000527026 PITPNM1O00562 1244 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRJ-204ENST00000527026 WDR62O43379 1518 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-204ENST00000527026 HAX1O00165 279 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-204ENST00000527026 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-204ENST00000527026 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
PTPRJ-204ENST00000527026 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PTPRJ-204ENST00000527026 TOPBP1Q92547 1522 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRJ-204ENST00000527026 ABCC8Q09428 1581 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRJ-204ENST00000527026 FBLN2P98095 1184 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-204ENST00000527026 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRJ-204ENST00000527026 IFT140Q96RY7 1462 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-204ENST00000527026 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRJ-204ENST00000527026 SOGA1O94964 1423 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-204ENST00000527026 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-204ENST00000527026 EVX2Q03828 476 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-204ENST00000527026 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.08
PTPRJ-204ENST00000527026 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRJ-204ENST00000527026 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-204ENST00000527026 SPDYE6P0CI01 402 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-204ENST00000527026 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-204ENST00000527026 CUX1P39880 1505 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-204ENST00000527026 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRJ-204ENST00000527026 FKBP8Q14318 412 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRJ-204ENST00000527026 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRJ-204ENST00000527026 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRJ-204ENST00000527026 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRJ-204ENST00000527026 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRJ-204ENST00000527026 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRJ-204ENST00000527026 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 TRIM41Q8WV44 630 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 SYNJ1O43426 1573 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 TOP2BQ02880 1626 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 CHD1O14646 1710 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 GRIN2BQ13224 1484 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 WDR97A6NE52 1622 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 PBRM1Q86U86 1689 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRJ-204ENST00000527026 SYNJ2O15056 1496 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRJ-204ENST00000527026 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRJ-204ENST00000527026 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRJ-204ENST00000527026 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRJ-204ENST00000527026 PROM2Q8N271 834 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRJ-204ENST00000527026 GABBR2O75899 941 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRJ-204ENST00000527026 ARHGEF11O15085 1522 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 CHADLQ6NUI6 762 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 IGF1RP08069 1367 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 KIF27Q86VH2 1401 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 GRIN2AQ12879 1464 aa15.08■□□□□ 0
PTPRJ-204ENST00000527026 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.07■□□□□ 0
PTPRJ-204ENST00000527026 ADAMTS12P58397 1594 aa15.06■□□□□ 0
PTPRJ-204ENST00000527026 PRR29P0C7W0 189 aa15.05■□□□□ -0
PTPRJ-204ENST00000527026 LHX8Q68G74 356 aa15.05■□□□□ -0
PTPRJ-204ENST00000527026 JPH4Q96JJ6 628 aa15.05■□□□□ -0
PTPRJ-204ENST00000527026 ARAP1Q96P48 1450 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 CEP170Q5SW79 1584 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 NUP160Q12769 1436 aa15□□□□□ -0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15□□□□□ -0.01
PTPRJ-204ENST00000527026 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-204ENST00000527026 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRJ-204ENST00000527026 CUL7Q14999 1698 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRJ-204ENST00000527026 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 FBXO3Q9UK99 471 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 SHROOM2Q13796 1616 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRJ-204ENST00000527026 POTEIP0CG38 1075 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
PTPRJ-204ENST00000527026 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 PTPRGP23470 1445 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 PRXQ9BXM0 1461 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 IQGAP2Q13576 1575 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 CLCN6P51797 869 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 P3H3Q8IVL6 736 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRJ-204ENST00000527026 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRJ-204ENST00000527026 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRJ-204ENST00000527026 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRJ-204ENST00000527026 EEA1Q15075 1411 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRJ-204ENST00000527026 DISP1Q96F81 1524 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms