RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527026.1

PTPRJ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRJ, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-204ENST00000527026 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PTPRJ-204ENST00000527026 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRJ-204ENST00000527026 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRJ-204ENST00000527026 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-204ENST00000527026 FOXD1Q16676 465 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRJ-204ENST00000527026 POTEDQ86YR6 584 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-204ENST00000527026 MSH5O43196 834 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRJ-204ENST00000527026 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRJ-204ENST00000527026 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRJ-204ENST00000527026 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-204ENST00000527026 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-204ENST00000527026 ADRA2BP18089 450 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-204ENST00000527026 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRJ-204ENST00000527026 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRJ-204ENST00000527026 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
PTPRJ-204ENST00000527026 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-204ENST00000527026 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19■□□□□ 0.63
PTPRJ-204ENST00000527026 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRJ-204ENST00000527026 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRJ-204ENST00000527026 ABCC9O60706 1549 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRJ-204ENST00000527026 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRJ-204ENST00000527026 RNF39Q9H2S5 420 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-204ENST00000527026 KCNA4P22459 653 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRJ-204ENST00000527026 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRJ-204ENST00000527026 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRJ-204ENST00000527026 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRJ-204ENST00000527026 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRJ-204ENST00000527026 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-204ENST00000527026 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-204ENST00000527026 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-204ENST00000527026 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-204ENST00000527026 NACADO15069 1562 aa17.96■□□□□ 0.46
PTPRJ-204ENST00000527026 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-204ENST00000527026 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-204ENST00000527026 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-204ENST00000527026 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.43
PTPRJ-204ENST00000527026 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRJ-204ENST00000527026 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRJ-204ENST00000527026 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRJ-204ENST00000527026 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.49■□□□□ 0.39
PTPRJ-204ENST00000527026 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
PTPRJ-204ENST00000527026 SCRIBQ14160 1630 aa17.43■□□□□ 0.38
PTPRJ-204ENST00000527026 CAPN15O75808 1086 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRJ-204ENST00000527026 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRJ-204ENST00000527026 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
PTPRJ-204ENST00000527026 DSG3P32926 999 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-204ENST00000527026 POTEHQ6S545 545 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-204ENST00000527026 SLC4A2P04920 1241 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRJ-204ENST00000527026 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRJ-204ENST00000527026 ZBTB22O15209 634 aa17.19■□□□□ 0.34
PTPRJ-204ENST00000527026 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.13■□□□□ 0.33
PTPRJ-204ENST00000527026 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRJ-204ENST00000527026 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRJ-204ENST00000527026 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
PTPRJ-204ENST00000527026 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRJ-204ENST00000527026 ABCB7O75027 752 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRJ-204ENST00000527026 APLP2Q06481 763 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRJ-204ENST00000527026 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-204ENST00000527026 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-204ENST00000527026 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-204ENST00000527026 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-204ENST00000527026 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-204ENST00000527026 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRJ-204ENST00000527026 SMARCA4P51532 1647 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRJ-204ENST00000527026 NCAPD3P42695 1498 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRJ-204ENST00000527026 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRJ-204ENST00000527026 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
PTPRJ-204ENST00000527026 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PTPRJ-204ENST00000527026 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-204ENST00000527026 SMARCA2P51531 1590 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-204ENST00000527026 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRJ-204ENST00000527026 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PTPRJ-204ENST00000527026 HMGXB3Q12766 1538 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-204ENST00000527026 POLA2Q14181 598 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-204ENST00000527026 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-204ENST00000527026 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-204ENST00000527026 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-204ENST00000527026 WIZO95785 1651 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-204ENST00000527026 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-204ENST00000527026 NESP48681 1621 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRJ-204ENST00000527026 ERCC6Q03468 1493 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRJ-204ENST00000527026 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRJ-204ENST00000527026 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRJ-204ENST00000527026 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRJ-204ENST00000527026 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRJ-204ENST00000527026 AKT1S1Q96B36 256 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRJ-204ENST00000527026 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-204ENST00000527026 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-204ENST00000527026 CUX2O14529 1486 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-204ENST00000527026 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-204ENST00000527026 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-204ENST00000527026 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRJ-204ENST00000527026 CFTRP13569 1480 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRJ-204ENST00000527026 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRJ-204ENST00000527026 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-204ENST00000527026 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-204ENST00000527026 OSCARQ8IYS5 282 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-204ENST00000527026 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-204ENST00000527026 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-204ENST00000527026 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms