RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 KCNH8Q96L42 1107 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-217ENST00000524534 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRK-217ENST00000524534 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRK-217ENST00000524534 WDR97A6NE52 1622 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRK-217ENST00000524534 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRK-217ENST00000524534 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRK-217ENST00000524534 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRK-217ENST00000524534 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRK-217ENST00000524534 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.43■□□□□ 0.22
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PTPRK-217ENST00000524534 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRK-217ENST00000524534 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRK-217ENST00000524534 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
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PTPRK-217ENST00000524534 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRK-217ENST00000524534 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRK-217ENST00000524534 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRK-217ENST00000524534 P3H3Q8IVL6 736 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRK-217ENST00000524534 FKBP8Q14318 412 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRK-217ENST00000524534 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRK-217ENST00000524534 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRK-217ENST00000524534 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
PTPRK-217ENST00000524534 BCANQ96GW7 911 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 ANP32CO43423 234 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 CUL7Q14999 1698 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 FMN1Q68DA7 1419 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 HFM1A2PYH4 1435 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 UACAQ9BZF9 1416 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 TONSLQ96HA7 1378 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 NEFLP07196 543 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRK-217ENST00000524534 PTPRKQ15262 1439 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRK-217ENST00000524534 TOPBP1Q92547 1522 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRK-217ENST00000524534 TRIM52Q96A61 297 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRK-217ENST00000524534 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRK-217ENST00000524534 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRK-217ENST00000524534 NAIPQ13075 1403 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-217ENST00000524534 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-217ENST00000524534 SAMD9Q5K651 1589 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-217ENST00000524534 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-217ENST00000524534 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-217ENST00000524534 NCOA2Q15596 1464 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-217ENST00000524534 GRIN2BQ13224 1484 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-217ENST00000524534 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-217ENST00000524534 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
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PTPRK-217ENST00000524534 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-217ENST00000524534 ARHGEF11O15085 1522 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-217ENST00000524534 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-217ENST00000524534 NESP48681 1621 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-217ENST00000524534 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-217ENST00000524534 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRK-217ENST00000524534 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRK-217ENST00000524534 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 AKNAQ7Z591 1439 aa16■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 HECW1Q76N89 1606 aa16■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-217ENST00000524534 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.95■□□□□ 0.14
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PTPRK-217ENST00000524534 KDM6BO15054 1643 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-217ENST00000524534 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-217ENST00000524534 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-217ENST00000524534 MSH5O43196 834 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-217ENST00000524534 MIA2Q96PC5 1412 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-217ENST00000524534 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-217ENST00000524534 NCOA1Q15788 1441 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-217ENST00000524534 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-217ENST00000524534 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-217ENST00000524534 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC7Q96M83 1385 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-217ENST00000524534 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC184Q52MB2 194 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-217ENST00000524534 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PTPRK-217ENST00000524534 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PTPRK-217ENST00000524534 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRK-217ENST00000524534 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRK-217ENST00000524534 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRK-217ENST00000524534 BCL11AQ9H165 835 aa15.85■□□□□ 0.13
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