RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 ERCC6Q03468 1493 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-208ENST00000519076 TOPBP1Q92547 1522 aa11.46□□□□□ -0.57
TRPS1-208ENST00000519076 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
TRPS1-208ENST00000519076 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.43□□□□□ -0.58
TRPS1-208ENST00000519076 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
TRPS1-208ENST00000519076 NEUROD1Q13562 356 aa11.41□□□□□ -0.58
TRPS1-208ENST00000519076 ARAP1Q96P48 1450 aa11.41□□□□□ -0.58
TRPS1-208ENST00000519076 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.4□□□□□ -0.58
TRPS1-208ENST00000519076 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.4□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.39□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.39□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.38□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM2Q13029 1718 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPS1-208ENST00000519076 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-208ENST00000519076 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-208ENST00000519076 FMN1Q68DA7 1419 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-208ENST00000519076 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM52Q96A61 297 aa11.27□□□□□ -0.61
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-208ENST00000519076 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-208ENST00000519076 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-208ENST00000519076 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-208ENST00000519076 GRIN2BQ13224 1484 aa11.21□□□□□ -0.61
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHG5O94827 1062 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 CUL7Q14999 1698 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 IFT140Q96RY7 1462 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 JPH4Q96JJ6 628 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 TIAM1Q13009 1591 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-208ENST00000519076 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
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TRPS1-208ENST00000519076 KCNH8Q96L42 1107 aa11.09□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.09□□□□□ -0.63
TRPS1-208ENST00000519076 IQGAP2Q13576 1575 aa11.08□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.08□□□□□ -0.64
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TRPS1-208ENST00000519076 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 NCOA2Q15596 1464 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 GRIN2AQ12879 1464 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
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TRPS1-208ENST00000519076 TSPY10P0CW01 314 aa11.04□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K1Q13233 1512 aa11.04□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.04□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 WDR62O43379 1518 aa11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TRPS1-208ENST00000519076 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 FOXD1Q16676 465 aa11.02□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTS12P58397 1594 aa11.01□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 SYNJ2O15056 1496 aa11.01□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 PBRM1Q86U86 1689 aa11□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 WDR97A6NE52 1622 aa11□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 PTPRGP23470 1445 aa11□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 ERICH6BQ5W0A0 696 aa10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 HECW1Q76N89 1606 aa10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.96□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
TRPS1-208ENST00000519076 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.95□□□□□ -0.66
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.94□□□□□ -0.66
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