RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492715.1

WDR13-209, Transcript of WD repeat domain 13, humanhuman

TSL 5

Gene WDR13, Length 2,612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR13-209ENST00000492715 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.21■■□□□ 1.47
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WDR13-209ENST00000492715 WDR97A6NE52 1622 aa24.14■■□□□ 1.46
WDR13-209ENST00000492715 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.14■■□□□ 1.46
WDR13-209ENST00000492715 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.14■■□□□ 1.46
WDR13-209ENST00000492715 ITGAEP38570 1179 aa24.14■■□□□ 1.45
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WDR13-209ENST00000492715 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.09■■□□□ 1.45
WDR13-209ENST00000492715 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.453e-9■■■■■ 30.6
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WDR13-209ENST00000492715 KCNH8Q96L42 1107 aa24.02■■□□□ 1.44
WDR13-209ENST00000492715 CCER2I3L3R5 266 aa24■■□□□ 1.43
WDR13-209ENST00000492715 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.98■■□□□ 1.43
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WDR13-209ENST00000492715 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.92■■□□□ 1.42
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WDR13-209ENST00000492715 HFM1A2PYH4 1435 aa23.85■■□□□ 1.41
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WDR13-209ENST00000492715 UACAQ9BZF9 1416 aa23.84■■□□□ 1.41
WDR13-209ENST00000492715 ANP32CO43423 234 aa23.83■■□□□ 1.41
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WDR13-209ENST00000492715 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
WDR13-209ENST00000492715 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.81■■□□□ 1.4
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WDR13-209ENST00000492715 TONSLQ96HA7 1378 aa23.78■■□□□ 1.4
WDR13-209ENST00000492715 SAMD9Q5K651 1589 aa23.78■■□□□ 1.4
WDR13-209ENST00000492715 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.77■■□□□ 1.4
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WDR13-209ENST00000492715 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.72■■□□□ 1.39
WDR13-209ENST00000492715 NAIPQ13075 1403 aa23.72■■□□□ 1.39
WDR13-209ENST00000492715 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
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WDR13-209ENST00000492715 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.7■■□□□ 1.38
WDR13-209ENST00000492715 GRIN2BQ13224 1484 aa23.7■■□□□ 1.38
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WDR13-209ENST00000492715 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.68■■□□□ 1.38
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WDR13-209ENST00000492715 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.67■■□□□ 1.38
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WDR13-209ENST00000492715 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.61■■□□□ 1.37
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WDR13-209ENST00000492715 HECW1Q76N89 1606 aa23.6■■□□□ 1.37
WDR13-209ENST00000492715 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
WDR13-209ENST00000492715 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.54■■□□□ 1.36
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WDR13-209ENST00000492715 NESP48681 1621 aa23.49■■□□□ 1.35
WDR13-209ENST00000492715 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.48■■□□□ 1.35
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WDR13-209ENST00000492715 BCL11AQ9H165 835 aa23.41■■□□□ 1.34
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WDR13-209ENST00000492715 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
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WDR13-209ENST00000492715 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
WDR13-209ENST00000492715 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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WDR13-209ENST00000492715 ROCK1Q13464 1354 aa23.32■■□□□ 1.32
WDR13-209ENST00000492715 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
WDR13-209ENST00000492715 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.31■■□□□ 1.32
WDR13-209ENST00000492715 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.31■■□□□ 1.32
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WDR13-209ENST00000492715 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.3■■□□□ 1.32
WDR13-209ENST00000492715 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
WDR13-209ENST00000492715 IQGAP2Q13576 1575 aa23.3■■□□□ 1.32
WDR13-209ENST00000492715 WDR62O43379 1518 aa23.29■■□□□ 1.32
WDR13-209ENST00000492715 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
WDR13-209ENST00000492715 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.27■■□□□ 1.32
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