RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484202.2

SH3BP5L-203, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 3,110 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-203ENST00000484202 BCL11AQ9H165 835 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5L-203ENST00000484202 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5L-203ENST00000484202 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5L-203ENST00000484202 KCNH8Q96L42 1107 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5L-203ENST00000484202 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5L-203ENST00000484202 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5L-203ENST00000484202 FKBP8Q14318 412 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5L-203ENST00000484202 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5L-203ENST00000484202 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5L-203ENST00000484202 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5L-203ENST00000484202 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5L-203ENST00000484202 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5L-203ENST00000484202 TIAM1Q13009 1591 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5L-203ENST00000484202 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5L-203ENST00000484202 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5L-203ENST00000484202 NEFLP07196 543 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5L-203ENST00000484202 MAPKBP1O60336 1514 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5L-203ENST00000484202 NESP48681 1621 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5L-203ENST00000484202 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5L-203ENST00000484202 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5L-203ENST00000484202 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.14■■□□□ 1.3
SH3BP5L-203ENST00000484202 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5L-203ENST00000484202 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5L-203ENST00000484202 WDR97A6NE52 1622 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5L-203ENST00000484202 ARID3CA6NKF2 412 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5L-203ENST00000484202 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5L-203ENST00000484202 MAP3K1Q13233 1512 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5L-203ENST00000484202 TRIM52Q96A61 297 aa23.08■■□□□ 1.28
SH3BP5L-203ENST00000484202 PRDM2Q13029 1718 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5L-203ENST00000484202 TOPBP1Q92547 1522 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5L-203ENST00000484202 TONSLQ96HA7 1378 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5L-203ENST00000484202 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5L-203ENST00000484202 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5L-203ENST00000484202 ANP32CO43423 234 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5L-203ENST00000484202 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP5L-203ENST00000484202 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP5L-203ENST00000484202 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP5L-203ENST00000484202 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5L-203ENST00000484202 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5L-203ENST00000484202 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5L-203ENST00000484202 FMN1Q68DA7 1419 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5L-203ENST00000484202 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5L-203ENST00000484202 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5L-203ENST00000484202 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5L-203ENST00000484202 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5L-203ENST00000484202 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5L-203ENST00000484202 MSH5O43196 834 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3BP5L-203ENST00000484202 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5L-203ENST00000484202 PTPRKQ15262 1439 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5L-203ENST00000484202 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5L-203ENST00000484202 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5L-203ENST00000484202 CCER2I3L3R5 266 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5L-203ENST00000484202 NCOA2Q15596 1464 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5L-203ENST00000484202 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.242e-6■■■□□ 18.3
SH3BP5L-203ENST00000484202 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5L-203ENST00000484202 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5L-203ENST00000484202 FOXD1Q16676 465 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5L-203ENST00000484202 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5L-203ENST00000484202 CUL7Q14999 1698 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5L-203ENST00000484202 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5L-203ENST00000484202 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5L-203ENST00000484202 UACAQ9BZF9 1416 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5L-203ENST00000484202 HFM1A2PYH4 1435 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5L-203ENST00000484202 NAIPQ13075 1403 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5L-203ENST00000484202 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5L-203ENST00000484202 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5L-203ENST00000484202 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5L-203ENST00000484202 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5L-203ENST00000484202 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5L-203ENST00000484202 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5L-203ENST00000484202 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5L-203ENST00000484202 GRIN2BQ13224 1484 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5L-203ENST00000484202 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 SAMD9Q5K651 1589 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5L-203ENST00000484202 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5L-203ENST00000484202 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5L-203ENST00000484202 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5L-203ENST00000484202 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5L-203ENST00000484202 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5L-203ENST00000484202 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5L-203ENST00000484202 FBLN2P98095 1184 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5L-203ENST00000484202 CCDC184Q52MB2 194 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5L-203ENST00000484202 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5L-203ENST00000484202 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5L-203ENST00000484202 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5L-203ENST00000484202 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5L-203ENST00000484202 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5L-203ENST00000484202 MRS2Q9HD23 443 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5L-203ENST00000484202 KDM6BO15054 1643 aa22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms