RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484202.2

SH3BP5L-203, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 3,110 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-203ENST00000484202 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.77■■■□□ 2.84
SH3BP5L-203ENST00000484202 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.75■■■□□ 2.19
SH3BP5L-203ENST00000484202 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SH3BP5L-203ENST00000484202 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.06■■■□□ 2.08
SH3BP5L-203ENST00000484202 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5L-203ENST00000484202 HRCP23327 699 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5L-203ENST00000484202 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5L-203ENST00000484202 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5L-203ENST00000484202 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP5L-203ENST00000484202 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5L-203ENST00000484202 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5L-203ENST00000484202 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5L-203ENST00000484202 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5L-203ENST00000484202 SCRIBQ14160 1630 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5L-203ENST00000484202 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SH3BP5L-203ENST00000484202 TRIM41Q8WV44 630 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP5L-203ENST00000484202 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5L-203ENST00000484202 ABCC9O60706 1549 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP5L-203ENST00000484202 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SH3BP5L-203ENST00000484202 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SH3BP5L-203ENST00000484202 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP5L-203ENST00000484202 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5L-203ENST00000484202 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5L-203ENST00000484202 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SH3BP5L-203ENST00000484202 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5L-203ENST00000484202 NACADO15069 1562 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP5L-203ENST00000484202 WIZO95785 1651 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP5L-203ENST00000484202 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP5L-203ENST00000484202 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5L-203ENST00000484202 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5L-203ENST00000484202 NEUROD1Q13562 356 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5L-203ENST00000484202 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5L-203ENST00000484202 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5L-203ENST00000484202 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5L-203ENST00000484202 ABCC8Q09428 1581 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP5L-203ENST00000484202 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5L-203ENST00000484202 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP5L-203ENST00000484202 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5L-203ENST00000484202 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SH3BP5L-203ENST00000484202 MYT1Q01538 1121 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP5L-203ENST00000484202 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SH3BP5L-203ENST00000484202 SOGA1O94964 1423 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP5L-203ENST00000484202 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5L-203ENST00000484202 SMARCA4P51532 1647 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP5L-203ENST00000484202 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5L-203ENST00000484202 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5L-203ENST00000484202 CEP162Q5TB80 1403 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5L-203ENST00000484202 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5L-203ENST00000484202 SMARCA2P51531 1590 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5L-203ENST00000484202 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5L-203ENST00000484202 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP5L-203ENST00000484202 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5L-203ENST00000484202 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5L-203ENST00000484202 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5L-203ENST00000484202 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP5L-203ENST00000484202 EEA1Q15075 1411 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP5L-203ENST00000484202 GOLGA3Q08378 1498 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP5L-203ENST00000484202 APLP2Q06481 763 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP5L-203ENST00000484202 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5L-203ENST00000484202 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.45■■□□□ 1.51
SH3BP5L-203ENST00000484202 CLIP1P30622 1438 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5L-203ENST00000484202 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5L-203ENST00000484202 SYNJ1O43426 1573 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP5L-203ENST00000484202 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5L-203ENST00000484202 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP5L-203ENST00000484202 MIER1Q8N108 512 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP5L-203ENST00000484202 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5L-203ENST00000484202 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5L-203ENST00000484202 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5L-203ENST00000484202 KIF21BO75037 1637 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP5L-203ENST00000484202 ITGAEP38570 1179 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP5L-203ENST00000484202 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5L-203ENST00000484202 TOP2BQ02880 1626 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP5L-203ENST00000484202 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5L-203ENST00000484202 KIF27Q86VH2 1401 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP5L-203ENST00000484202 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SH3BP5L-203ENST00000484202 PRXQ9BXM0 1461 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5L-203ENST00000484202 ARAP1Q96P48 1450 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5L-203ENST00000484202 CUX1P39880 1505 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5L-203ENST00000484202 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5L-203ENST00000484202 NCAPD3P42695 1498 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5L-203ENST00000484202 P3H3Q8IVL6 736 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5L-203ENST00000484202 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5L-203ENST00000484202 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5L-203ENST00000484202 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP5L-203ENST00000484202 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5L-203ENST00000484202 CUX2O14529 1486 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5L-203ENST00000484202 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5L-203ENST00000484202 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5L-203ENST00000484202 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5L-203ENST00000484202 CFTRP13569 1480 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5L-203ENST00000484202 HMGXB3Q12766 1538 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5L-203ENST00000484202 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5L-203ENST00000484202 IGF1RP08069 1367 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5L-203ENST00000484202 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5L-203ENST00000484202 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5L-203ENST00000484202 BCANQ96GW7 911 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5L-203ENST00000484202 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5L-203ENST00000484202 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms