RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP1-206ENST00000469947 NEFLP07196 543 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-206ENST00000469947 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC24A1O60721 1099 aa19.21■□□□□ 0.66
SH3BP1-206ENST00000469947 WDR97A6NE52 1622 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-206ENST00000469947 CUX1P39880 1505 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-206ENST00000469947 NESP48681 1621 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 MSH5O43196 834 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 PRDM2Q13029 1718 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 ANP32CO43423 234 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF27Q86VH2 1401 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 CCER2I3L3R5 266 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 P3H3Q8IVL6 736 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 TIAM1Q13009 1591 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-206ENST00000469947 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-206ENST00000469947 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-206ENST00000469947 MAP3K1Q13233 1512 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-206ENST00000469947 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-206ENST00000469947 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-206ENST00000469947 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-206ENST00000469947 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 TONSLQ96HA7 1378 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 IGF1RP08069 1367 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 TOPBP1Q92547 1522 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.77■□□□□ 0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC184Q52MB2 194 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PTPRKQ15262 1439 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 31.2
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SH3BP1-206ENST00000469947 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 UACAQ9BZF9 1416 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 NBR1Q14596 966 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 HFM1A2PYH4 1435 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 MRS2Q9HD23 443 aa18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1-206ENST00000469947 NAIPQ13075 1403 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.569e-9■■■■□ 19.6
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 ERCC6Q03468 1493 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXD1Q16676 465 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 FMN1Q68DA7 1419 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 NCOA2Q15596 1464 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 AKNAQ7Z591 1439 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC7Q96M83 1385 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 WDR62O43379 1518 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 CUL7Q14999 1698 aa18.43■□□□□ 0.54
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