RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430356.3

PITRM1-AS1-201, PITRM1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PITRM1-AS1, Length 3,998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NEFLP07196 543 aa12.14□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TOPBP1Q92547 1522 aa12.13□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MAPKBP1O60336 1514 aa12.12□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FKBP8Q14318 412 aa12.11□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ERCC6Q03468 1493 aa12.1□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.09□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PRXQ9BXM0 1461 aa12.09□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.09□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CLIP1P30622 1438 aa12.08□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIF27Q86VH2 1401 aa12.08□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARAP1Q96P48 1450 aa12.07□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ITGAEP38570 1179 aa12.06□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.06□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.04□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.04□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.02□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IGF1RP08069 1367 aa12.02□□□□□ -0.49
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KCNH8Q96L42 1107 aa12.01□□□□□ -0.49
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PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.97□□□□□ -0.49
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.97□□□□□ -0.49
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRIM52Q96A61 297 aa11.95□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.92□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TIAM1Q13009 1591 aa11.91□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 WDR62O43379 1518 aa11.91□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
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PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.89□□□□□ -0.51
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ANP32CO43423 234 aa11.87□□□□□ -0.51
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 WDR97A6NE52 1622 aa11.87□□□□□ -0.51
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FBLN2P98095 1184 aa11.86□□□□□ -0.51
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.86□□□□□ -0.51
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IFT140Q96RY7 1462 aa11.85□□□□□ -0.51
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARHGEF11O15085 1522 aa11.82□□□□□ -0.52
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NCOA2Q15596 1464 aa11.81□□□□□ -0.52
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HECW1Q76N89 1606 aa11.81□□□□□ -0.52
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GRIN2BQ13224 1484 aa11.79□□□□□ -0.52
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.78□□□□□ -0.52
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.78□□□□□ -0.52
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.78□□□□□ -0.52
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PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.78□□□□□ -0.52
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PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.77□□□□□ -0.52
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MSH5O43196 834 aa11.77□□□□□ -0.52
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PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.75□□□□□ -0.53
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SAMD9Q5K651 1589 aa11.74□□□□□ -0.53
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.72□□□□□ -0.53
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ADAMTS12P58397 1594 aa11.72□□□□□ -0.53
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NBR1Q14596 966 aa11.72□□□□□ -0.53
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.72□□□□□ -0.53
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PITRM1-AS1-201ENST00000430356 E9PCH4 1651 aa11.71□□□□□ -0.53
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PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.69□□□□□ -0.54
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.69□□□□□ -0.54
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARID3CA6NKF2 412 aa11.69□□□□□ -0.54
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.68□□□□□ -0.54
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.67□□□□□ -0.54
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PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.66□□□□□ -0.54
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PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SYNJ2O15056 1496 aa11.65□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.63□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.62□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TONSLQ96HA7 1378 aa11.61□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.61□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IQGAP2Q13576 1575 aa11.61□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.6□□□□□ -0.55
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.6□□□□□ -0.55
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