RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409265.8

NLRX1-203, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NLRX1, Length 3,665 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-203ENST00000409265 FKBP8Q14318 412 aa15.6■□□□□ 0.09
NLRX1-203ENST00000409265 MSH5O43196 834 aa15.59■□□□□ 0.09
NLRX1-203ENST00000409265 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.57■□□□□ 0.08
NLRX1-203ENST00000409265 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.56■□□□□ 0.08
NLRX1-203ENST00000409265 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.54■□□□□ 0.08
NLRX1-203ENST00000409265 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.52■□□□□ 0.08
NLRX1-203ENST00000409265 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
NLRX1-203ENST00000409265 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.51■□□□□ 0.07
NLRX1-203ENST00000409265 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.51■□□□□ 0.07
NLRX1-203ENST00000409265 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NLRX1-203ENST00000409265 NESP48681 1621 aa15.49■□□□□ 0.07
NLRX1-203ENST00000409265 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.48■□□□□ 0.07
NLRX1-203ENST00000409265 NEFLP07196 543 aa15.47■□□□□ 0.07
NLRX1-203ENST00000409265 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.47■□□□□ 0.07
NLRX1-203ENST00000409265 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NLRX1-203ENST00000409265 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
NLRX1-203ENST00000409265 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.42■□□□□ 0.06
NLRX1-203ENST00000409265 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
NLRX1-203ENST00000409265 KCNH8Q96L42 1107 aa15.41■□□□□ 0.06
NLRX1-203ENST00000409265 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.4■□□□□ 0.06
NLRX1-203ENST00000409265 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.4■□□□□ 0.06
NLRX1-203ENST00000409265 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.39■□□□□ 0.05
NLRX1-203ENST00000409265 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.37■□□□□ 0.05
NLRX1-203ENST00000409265 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.37■□□□□ 0.05
NLRX1-203ENST00000409265 ARID3CA6NKF2 412 aa15.37■□□□□ 0.05
NLRX1-203ENST00000409265 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.36■□□□□ 0.05
NLRX1-203ENST00000409265 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
NLRX1-203ENST00000409265 TOPBP1Q92547 1522 aa15.35■□□□□ 0.05
NLRX1-203ENST00000409265 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.33■□□□□ 0.04
NLRX1-203ENST00000409265 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.32■□□□□ 0.04
NLRX1-203ENST00000409265 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
NLRX1-203ENST00000409265 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.3■□□□□ 0.04
NLRX1-203ENST00000409265 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.3■□□□□ 0.04
NLRX1-203ENST00000409265 TIAM1Q13009 1591 aa15.3■□□□□ 0.04
NLRX1-203ENST00000409265 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
NLRX1-203ENST00000409265 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.29■□□□□ 0.04
NLRX1-203ENST00000409265 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.28■□□□□ 0.04
NLRX1-203ENST00000409265 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.26■□□□□ 0.03
NLRX1-203ENST00000409265 PRDM2Q13029 1718 aa15.25■□□□□ 0.03
NLRX1-203ENST00000409265 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
NLRX1-203ENST00000409265 NBR1Q14596 966 aa15.25■□□□□ 0.03
NLRX1-203ENST00000409265 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.25■□□□□ 0.03
NLRX1-203ENST00000409265 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.24■□□□□ 0.03
NLRX1-203ENST00000409265 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
NLRX1-203ENST00000409265 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
NLRX1-203ENST00000409265 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.21■□□□□ 0.03
NLRX1-203ENST00000409265 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
NLRX1-203ENST00000409265 FMN1Q68DA7 1419 aa15.2■□□□□ 0.02
NLRX1-203ENST00000409265 TRIM52Q96A61 297 aa15.2■□□□□ 0.02
NLRX1-203ENST00000409265 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.2■□□□□ 0.02
NLRX1-203ENST00000409265 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.19■□□□□ 0.02
NLRX1-203ENST00000409265 MAP3K1Q13233 1512 aa15.19■□□□□ 0.02
NLRX1-203ENST00000409265 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
NLRX1-203ENST00000409265 IL27Q8NEV9 243 aa15.15■□□□□ 0.02
NLRX1-203ENST00000409265 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.15■□□□□ 0.02
NLRX1-203ENST00000409265 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 TONSLQ96HA7 1378 aa15.13■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 FBLN2P98095 1184 aa15.13■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.12■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 MAPKBP1O60336 1514 aa15.12■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.12■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.12■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 CUL7Q14999 1698 aa15.08■□□□□ 0.01
NLRX1-203ENST00000409265 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NLRX1-203ENST00000409265 WDR97A6NE52 1622 aa15.06■□□□□ 0
NLRX1-203ENST00000409265 NCOA2Q15596 1464 aa15.05■□□□□ 0
NLRX1-203ENST00000409265 PTPRKQ15262 1439 aa15.05■□□□□ 0
NLRX1-203ENST00000409265 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.05■□□□□ -0
NLRX1-203ENST00000409265 ANP32CO43423 234 aa15.04■□□□□ -0
NLRX1-203ENST00000409265 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.03■□□□□ -0
NLRX1-203ENST00000409265 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.03■□□□□ -0
NLRX1-203ENST00000409265 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.03■□□□□ -0
NLRX1-203ENST00000409265 FOXD1Q16676 465 aa15.03■□□□□ -0
NLRX1-203ENST00000409265 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.02■□□□□ -0
NLRX1-203ENST00000409265 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 GRIN2BQ13224 1484 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 CCER2I3L3R5 266 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 NAIPQ13075 1403 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 HFM1A2PYH4 1435 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRX1-203ENST00000409265 UACAQ9BZF9 1416 aa14.96□□□□□ -0.02
NLRX1-203ENST00000409265 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NLRX1-203ENST00000409265 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRX1-203ENST00000409265 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NLRX1-203ENST00000409265 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRX1-203ENST00000409265 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NLRX1-203ENST00000409265 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRX1-203ENST00000409265 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NLRX1-203ENST00000409265 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRX1-203ENST00000409265 SAMD9Q5K651 1589 aa14.91□□□□□ -0.02
NLRX1-203ENST00000409265 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 256.5 ms