RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395010.5

LRRC20-205, Transcript of leucine rich repeat containing 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LRRC20, Length 2,959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC20-205ENST00000395010 PRDM2Q13029 1718 aa27.12■■□□□ 1.93
LRRC20-205ENST00000395010 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.11■■□□□ 1.93
LRRC20-205ENST00000395010 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.1■■□□□ 1.93
LRRC20-205ENST00000395010 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.1■■□□□ 1.93
LRRC20-205ENST00000395010 MAPKBP1O60336 1514 aa27.07■■□□□ 1.92
LRRC20-205ENST00000395010 KCNH8Q96L42 1107 aa27.06■■□□□ 1.92
LRRC20-205ENST00000395010 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.05■■□□□ 1.92
LRRC20-205ENST00000395010 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.05■■□□□ 1.92
LRRC20-205ENST00000395010 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
LRRC20-205ENST00000395010 NESP48681 1621 aa27.02■■□□□ 1.92
LRRC20-205ENST00000395010 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27■■□□□ 1.91
LRRC20-205ENST00000395010 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LRRC20-205ENST00000395010 MAP3K1Q13233 1512 aa26.97■■□□□ 1.91
LRRC20-205ENST00000395010 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
LRRC20-205ENST00000395010 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
LRRC20-205ENST00000395010 TOPBP1Q92547 1522 aa26.91■■□□□ 1.9
LRRC20-205ENST00000395010 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
LRRC20-205ENST00000395010 WDR97A6NE52 1622 aa26.88■■□□□ 1.89
LRRC20-205ENST00000395010 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.86■■□□□ 1.89
LRRC20-205ENST00000395010 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.86■■□□□ 1.89
LRRC20-205ENST00000395010 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
LRRC20-205ENST00000395010 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.84■■□□□ 1.89
LRRC20-205ENST00000395010 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.79■■□□□ 1.88
LRRC20-205ENST00000395010 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.79■■□□□ 1.88
LRRC20-205ENST00000395010 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.76■■□□□ 1.88
LRRC20-205ENST00000395010 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.75■■□□□ 1.87
LRRC20-205ENST00000395010 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.71■■□□□ 1.87
LRRC20-205ENST00000395010 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.71■■□□□ 1.87
LRRC20-205ENST00000395010 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
LRRC20-205ENST00000395010 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
LRRC20-205ENST00000395010 FMN1Q68DA7 1419 aa26.68■■□□□ 1.86
LRRC20-205ENST00000395010 PTPRKQ15262 1439 aa26.68■■□□□ 1.86
LRRC20-205ENST00000395010 BCANQ96GW7 911 aa26.67■■□□□ 1.86
LRRC20-205ENST00000395010 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.65■■□□□ 1.86
LRRC20-205ENST00000395010 CUL7Q14999 1698 aa26.64■■□□□ 1.86
LRRC20-205ENST00000395010 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.86
LRRC20-205ENST00000395010 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.63■■□□□ 1.85
LRRC20-205ENST00000395010 ARID3CA6NKF2 412 aa26.63■■□□□ 1.85
LRRC20-205ENST00000395010 TONSLQ96HA7 1378 aa26.61■■□□□ 1.85
LRRC20-205ENST00000395010 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.61■■□□□ 1.85
LRRC20-205ENST00000395010 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.59■■□□□ 1.85
LRRC20-205ENST00000395010 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.58■■□□□ 1.85
LRRC20-205ENST00000395010 TRIM52Q96A61 297 aa26.57■■□□□ 1.84
LRRC20-205ENST00000395010 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
LRRC20-205ENST00000395010 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.56■■□□□ 1.84
LRRC20-205ENST00000395010 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.56■■□□□ 1.84
LRRC20-205ENST00000395010 NCOA2Q15596 1464 aa26.55■■□□□ 1.84
LRRC20-205ENST00000395010 ANP32CO43423 234 aa26.51■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 HFM1A2PYH4 1435 aa26.5■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 FKBP8Q14318 412 aa26.5■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.5■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.49■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 NAIPQ13075 1403 aa26.49■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 UACAQ9BZF9 1416 aa26.48■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 GRIN2BQ13224 1484 aa26.47■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.47■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.46■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.46■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.46■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 SAMD9Q5K651 1589 aa26.45■■□□□ 1.83
LRRC20-205ENST00000395010 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.42■■□□□ 1.82
LRRC20-205ENST00000395010 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.41■■□□□ 1.82
LRRC20-205ENST00000395010 FOXD1Q16676 465 aa26.37■■□□□ 1.81
LRRC20-205ENST00000395010 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
LRRC20-205ENST00000395010 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.34■■□□□ 1.81
LRRC20-205ENST00000395010 CCER2I3L3R5 266 aa26.34■■□□□ 1.81
LRRC20-205ENST00000395010 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.33■■□□□ 1.8
LRRC20-205ENST00000395010 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.31■■□□□ 1.8
LRRC20-205ENST00000395010 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
LRRC20-205ENST00000395010 NEFLP07196 543 aa26.27■■□□□ 1.8
LRRC20-205ENST00000395010 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
LRRC20-205ENST00000395010 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.25■■□□□ 1.79
LRRC20-205ENST00000395010 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
LRRC20-205ENST00000395010 MYT1Q01538 1121 aa26.24■■□□□ 1.79
LRRC20-205ENST00000395010 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
LRRC20-205ENST00000395010 KDM6BO15054 1643 aa26.24■■□□□ 1.79
LRRC20-205ENST00000395010 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
LRRC20-205ENST00000395010 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
LRRC20-205ENST00000395010 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.22■■□□□ 1.79
LRRC20-205ENST00000395010 ARHGEF11O15085 1522 aa26.21■■□□□ 1.79
LRRC20-205ENST00000395010 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.21■■□□□ 1.79
LRRC20-205ENST00000395010 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
LRRC20-205ENST00000395010 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
LRRC20-205ENST00000395010 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.18■■□□□ 1.78
LRRC20-205ENST00000395010 IQGAP2Q13576 1575 aa26.18■■□□□ 1.78
LRRC20-205ENST00000395010 HECW1Q76N89 1606 aa26.16■■□□□ 1.78
LRRC20-205ENST00000395010 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
LRRC20-205ENST00000395010 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
LRRC20-205ENST00000395010 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.771e-7■■■■□ 19.4
LRRC20-205ENST00000395010 PBRM1Q86U86 1689 aa26.11■■□□□ 1.77
LRRC20-205ENST00000395010 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
LRRC20-205ENST00000395010 CCDC184Q52MB2 194 aa26.11■■□□□ 1.77
LRRC20-205ENST00000395010 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
LRRC20-205ENST00000395010 ADAMTS12P58397 1594 aa26.08■■□□□ 1.77
LRRC20-205ENST00000395010 WDR62O43379 1518 aa26.07■■□□□ 1.76
LRRC20-205ENST00000395010 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.05■■□□□ 1.76
LRRC20-205ENST00000395010 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.05■■□□□ 1.76
LRRC20-205ENST00000395010 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
LRRC20-205ENST00000395010 MIA2Q96PC5 1412 aa26.04■■□□□ 1.76
LRRC20-205ENST00000395010 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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