RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383791.7

SH3BP5-202, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 2,822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-202ENST00000383791 CFTRP13569 1480 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5-202ENST00000383791 IGF1RP08069 1367 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5-202ENST00000383791 HMGXB3Q12766 1538 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-202ENST00000383791 TRIM52Q96A61 297 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-202ENST00000383791 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-202ENST00000383791 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5-202ENST00000383791 MAPKBP1O60336 1514 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5-202ENST00000383791 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5-202ENST00000383791 TIAM1Q13009 1591 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5-202ENST00000383791 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-202ENST00000383791 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-202ENST00000383791 WDR97A6NE52 1622 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-202ENST00000383791 NEFLP07196 543 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-202ENST00000383791 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-202ENST00000383791 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-202ENST00000383791 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-202ENST00000383791 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-202ENST00000383791 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-202ENST00000383791 ANP32CO43423 234 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-202ENST00000383791 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-202ENST00000383791 BCL11AQ9H165 835 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-202ENST00000383791 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-202ENST00000383791 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-202ENST00000383791 MAP3K1Q13233 1512 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-202ENST00000383791 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-202ENST00000383791 PRDM2Q13029 1718 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-202ENST00000383791 NESP48681 1621 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-202ENST00000383791 CCER2I3L3R5 266 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-202ENST00000383791 TONSLQ96HA7 1378 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-202ENST00000383791 MSH5O43196 834 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-202ENST00000383791 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.326e-8■□□□□ 10.1
SH3BP5-202ENST00000383791 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5-202ENST00000383791 PTPRKQ15262 1439 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-202ENST00000383791 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-202ENST00000383791 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-202ENST00000383791 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5-202ENST00000383791 ARID3CA6NKF2 412 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5-202ENST00000383791 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5-202ENST00000383791 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5-202ENST00000383791 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5-202ENST00000383791 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5-202ENST00000383791 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5-202ENST00000383791 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5-202ENST00000383791 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5-202ENST00000383791 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-202ENST00000383791 TOPBP1Q92547 1522 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-202ENST00000383791 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.33e-8■■■■■ 26.9
SH3BP5-202ENST00000383791 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5-202ENST00000383791 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 FMN1Q68DA7 1419 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 FOXD1Q16676 465 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 NAIPQ13075 1403 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 UACAQ9BZF9 1416 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 CCDC184Q52MB2 194 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 NCOA2Q15596 1464 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 HFM1A2PYH4 1435 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP5-202ENST00000383791 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP5-202ENST00000383791 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5-202ENST00000383791 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5-202ENST00000383791 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5-202ENST00000383791 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-202ENST00000383791 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-202ENST00000383791 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-202ENST00000383791 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5-202ENST00000383791 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5-202ENST00000383791 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP5-202ENST00000383791 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP5-202ENST00000383791 CUL7Q14999 1698 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP5-202ENST00000383791 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-202ENST00000383791 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-202ENST00000383791 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-202ENST00000383791 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-202ENST00000383791 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-202ENST00000383791 GRIN2BQ13224 1484 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-202ENST00000383791 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-202ENST00000383791 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-202ENST00000383791 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-202ENST00000383791 KDM6BO15054 1643 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-202ENST00000383791 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5-202ENST00000383791 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 30.9
SH3BP5-202ENST00000383791 MRS2Q9HD23 443 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5-202ENST00000383791 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5-202ENST00000383791 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5-202ENST00000383791 SAMD9Q5K651 1589 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5-202ENST00000383791 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-202ENST00000383791 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5-202ENST00000383791 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5-202ENST00000383791 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5-202ENST00000383791 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5-202ENST00000383791 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-202ENST00000383791 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-202ENST00000383791 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-202ENST00000383791 NBR1Q14596 966 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-202ENST00000383791 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5-202ENST00000383791 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 359.6 ms