RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-201ENST00000379445 FBLN2P98095 1184 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-201ENST00000379445 GRIN2BQ13224 1484 aa12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-201ENST00000379445 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-201ENST00000379445 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-201ENST00000379445 ARAP1Q96P48 1450 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-201ENST00000379445 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.54□□□□□ -0.4
CTXN3-201ENST00000379445 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.53□□□□□ -0.4
CTXN3-201ENST00000379445 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CTXN3-201ENST00000379445 SYNJ2O15056 1496 aa12.52□□□□□ -0.4
CTXN3-201ENST00000379445 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.51□□□□□ -0.41
CTXN3-201ENST00000379445 SLC4A2P04920 1241 aa12.51□□□□□ -0.41
CTXN3-201ENST00000379445 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.51□□□□□ -0.41
CTXN3-201ENST00000379445 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.5□□□□□ -0.41
CTXN3-201ENST00000379445 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
CTXN3-201ENST00000379445 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CTXN3-201ENST00000379445 SYNJ1O43426 1573 aa12.49□□□□□ -0.41
CTXN3-201ENST00000379445 PBRM1Q86U86 1689 aa12.47□□□□□ -0.41
CTXN3-201ENST00000379445 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.46□□□□□ -0.41
CTXN3-201ENST00000379445 TOP2BQ02880 1626 aa12.45□□□□□ -0.42
CTXN3-201ENST00000379445 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.45□□□□□ -0.42
CTXN3-201ENST00000379445 CAPN15O75808 1086 aa12.45□□□□□ -0.42
CTXN3-201ENST00000379445 DSG3P32926 999 aa12.43□□□□□ -0.42
CTXN3-201ENST00000379445 ADAMTS12P58397 1594 aa12.41□□□□□ -0.42
CTXN3-201ENST00000379445 GRIN2AQ12879 1464 aa12.4□□□□□ -0.42
CTXN3-201ENST00000379445 NUP160Q12769 1436 aa12.38□□□□□ -0.43
CTXN3-201ENST00000379445 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
CTXN3-201ENST00000379445 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.37□□□□□ -0.43
CTXN3-201ENST00000379445 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.37□□□□□ -0.43
CTXN3-201ENST00000379445 CEP170Q5SW79 1584 aa12.36□□□□□ -0.43
CTXN3-201ENST00000379445 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CTXN3-201ENST00000379445 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.33□□□□□ -0.44
CTXN3-201ENST00000379445 SHROOM2Q13796 1616 aa12.3□□□□□ -0.44
CTXN3-201ENST00000379445 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CTXN3-201ENST00000379445 APLP2Q06481 763 aa12.27□□□□□ -0.45
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CTXN3-201ENST00000379445 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTXN3-201ENST00000379445 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.24□□□□□ -0.45
CTXN3-201ENST00000379445 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CTXN3-201ENST00000379445 IGF1RP08069 1367 aa12.21□□□□□ -0.45
CTXN3-201ENST00000379445 JPH4Q96JJ6 628 aa12.21□□□□□ -0.45
CTXN3-201ENST00000379445 KIF27Q86VH2 1401 aa12.2□□□□□ -0.46
CTXN3-201ENST00000379445 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTXN3-201ENST00000379445 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.17□□□□□ -0.46
CTXN3-201ENST00000379445 CUL7Q14999 1698 aa12.17□□□□□ -0.46
CTXN3-201ENST00000379445 ABCB7O75027 752 aa12.15□□□□□ -0.46
CTXN3-201ENST00000379445 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.11□□□□□ -0.47
CTXN3-201ENST00000379445 ADCY10Q96PN6 1610 aa12.09□□□□□ -0.47
CTXN3-201ENST00000379445 MAPKBP1O60336 1514 aa12.09□□□□□ -0.47
CTXN3-201ENST00000379445 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CTXN3-201ENST00000379445 ABCC10Q5T3U5 1492 aa12.07□□□□□ -0.48
CTXN3-201ENST00000379445 KIF13AQ9H1H9 1805 aa12.07□□□□□ -0.48
CTXN3-201ENST00000379445 DIP2BQ9P265 1576 aa12.04□□□□□ -0.48
CTXN3-201ENST00000379445 IQGAP2Q13576 1575 aa12.03□□□□□ -0.48
CTXN3-201ENST00000379445 PTPRGP23470 1445 aa12.03□□□□□ -0.48
CTXN3-201ENST00000379445 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
CTXN3-201ENST00000379445 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.02□□□□□ -0.49
CTXN3-201ENST00000379445 TNIKQ9UKE5 1360 aa12.02□□□□□ -0.49
CTXN3-201ENST00000379445 ZBTB22O15209 634 aa12.01□□□□□ -0.49
CTXN3-201ENST00000379445 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.01□□□□□ -0.49
CTXN3-201ENST00000379445 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.01□□□□□ -0.49
CTXN3-201ENST00000379445 DISP1Q96F81 1524 aa12□□□□□ -0.49
CTXN3-201ENST00000379445 ABCC2Q92887 1545 aa11.99□□□□□ -0.49
CTXN3-201ENST00000379445 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.98□□□□□ -0.49
CTXN3-201ENST00000379445 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.98□□□□□ -0.49
CTXN3-201ENST00000379445 UACAQ9BZF9 1416 aa11.95□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 KIAA0556O60303 1618 aa11.94□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 ASXL2Q76L83 1435 aa11.93□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 PRXQ9BXM0 1461 aa11.93□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.92□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.92□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 POLA2Q14181 598 aa11.91□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.91□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 GLI2P10070 1586 aa11.91□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 KDM6BO15054 1643 aa11.9□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CTXN3-201ENST00000379445 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.87□□□□□ -0.51
CTXN3-201ENST00000379445 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CTXN3-201ENST00000379445 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CTXN3-201ENST00000379445 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CTXN3-201ENST00000379445 GOLGA3Q08378 1498 aa11.86□□□□□ -0.51
CTXN3-201ENST00000379445 TSPOAP1O95153 1857 aa11.85□□□□□ -0.51
CTXN3-201ENST00000379445 ABCA8O94911 1581 aa11.84□□□□□ -0.51
CTXN3-201ENST00000379445 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.83□□□□□ -0.52
CTXN3-201ENST00000379445 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CTXN3-201ENST00000379445 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.83□□□□□ -0.52
CTXN3-201ENST00000379445 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CTXN3-201ENST00000379445 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CTXN3-201ENST00000379445 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.79□□□□□ -0.52
CTXN3-201ENST00000379445 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.78□□□□□ -0.52
CTXN3-201ENST00000379445 EEA1Q15075 1411 aa11.76□□□□□ -0.53
CTXN3-201ENST00000379445 SAMD9Q5K651 1589 aa11.76□□□□□ -0.53
CTXN3-201ENST00000379445 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.75□□□□□ -0.53
CTXN3-201ENST00000379445 CD109Q6YHK3 1445 aa11.73□□□□□ -0.53
CTXN3-201ENST00000379445 ATP10BO94823 1461 aa11.73□□□□□ -0.53
CTXN3-201ENST00000379445 P3H3Q8IVL6 736 aa11.72□□□□□ -0.53
CTXN3-201ENST00000379445 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.72□□□□□ -0.53
CTXN3-201ENST00000379445 KCNH8Q96L42 1107 aa11.71□□□□□ -0.54
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