RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376495.4

OTUD1-201, Transcript of OTU deubiquitinase 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene OTUD1, Length 2,933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1-201ENST00000376495 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.3■■□□□ 1.96
OTUD1-201ENST00000376495 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.26■■□□□ 1.95
OTUD1-201ENST00000376495 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.24■■□□□ 1.95
OTUD1-201ENST00000376495 TIAM1Q13009 1591 aa27.24■■□□□ 1.95
OTUD1-201ENST00000376495 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.23■■□□□ 1.95
OTUD1-201ENST00000376495 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.23■■□□□ 1.95
OTUD1-201ENST00000376495 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
OTUD1-201ENST00000376495 NESP48681 1621 aa27.18■■□□□ 1.94
OTUD1-201ENST00000376495 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.16■■□□□ 1.94
OTUD1-201ENST00000376495 MAPKBP1O60336 1514 aa27.15■■□□□ 1.94
OTUD1-201ENST00000376495 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.14■■□□□ 1.94
OTUD1-201ENST00000376495 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
OTUD1-201ENST00000376495 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
OTUD1-201ENST00000376495 PRDM2Q13029 1718 aa27.08■■□□□ 1.93
OTUD1-201ENST00000376495 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
OTUD1-201ENST00000376495 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
OTUD1-201ENST00000376495 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.03■■□□□ 1.92
OTUD1-201ENST00000376495 WDR97A6NE52 1622 aa27.03■■□□□ 1.92
OTUD1-201ENST00000376495 MAP3K1Q13233 1512 aa27.02■■□□□ 1.92
OTUD1-201ENST00000376495 TOPBP1Q92547 1522 aa27.01■■□□□ 1.91
OTUD1-201ENST00000376495 ARID3CA6NKF2 412 aa26.98■■□□□ 1.91
OTUD1-201ENST00000376495 BCANQ96GW7 911 aa26.97■■□□□ 1.91
OTUD1-201ENST00000376495 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.97■■□□□ 1.91
OTUD1-201ENST00000376495 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.94■■□□□ 1.9
OTUD1-201ENST00000376495 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
OTUD1-201ENST00000376495 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.92■■□□□ 1.9
OTUD1-201ENST00000376495 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.9■■□□□ 1.9
OTUD1-201ENST00000376495 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.9■■□□□ 1.9
OTUD1-201ENST00000376495 TRIM52Q96A61 297 aa26.88■■□□□ 1.89
OTUD1-201ENST00000376495 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.87■■□□□ 1.89
OTUD1-201ENST00000376495 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.84■■□□□ 1.89
OTUD1-201ENST00000376495 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.84■■□□□ 1.89
OTUD1-201ENST00000376495 TONSLQ96HA7 1378 aa26.84■■□□□ 1.89
OTUD1-201ENST00000376495 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.83■■□□□ 1.89
OTUD1-201ENST00000376495 FMN1Q68DA7 1419 aa26.83■■□□□ 1.88
OTUD1-201ENST00000376495 PTPRKQ15262 1439 aa26.82■■□□□ 1.88
OTUD1-201ENST00000376495 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
OTUD1-201ENST00000376495 ANP32CO43423 234 aa26.78■■□□□ 1.88
OTUD1-201ENST00000376495 FKBP8Q14318 412 aa26.78■■□□□ 1.88
OTUD1-201ENST00000376495 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.76■■□□□ 1.87
OTUD1-201ENST00000376495 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.75■■□□□ 1.87
OTUD1-201ENST00000376495 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.74■■□□□ 1.87
OTUD1-201ENST00000376495 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.73■■□□□ 1.87
OTUD1-201ENST00000376495 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.71■■□□□ 1.87
OTUD1-201ENST00000376495 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
OTUD1-201ENST00000376495 NCOA2Q15596 1464 aa26.68■■□□□ 1.86
OTUD1-201ENST00000376495 CUL7Q14999 1698 aa26.68■■□□□ 1.86
OTUD1-201ENST00000376495 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.66■■□□□ 1.86
OTUD1-201ENST00000376495 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.66■■□□□ 1.86
OTUD1-201ENST00000376495 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
OTUD1-201ENST00000376495 FOXD1Q16676 465 aa26.65■■□□□ 1.86
OTUD1-201ENST00000376495 NAIPQ13075 1403 aa26.63■■□□□ 1.85
OTUD1-201ENST00000376495 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.63■■□□□ 1.85
OTUD1-201ENST00000376495 HFM1A2PYH4 1435 aa26.62■■□□□ 1.85
OTUD1-201ENST00000376495 UACAQ9BZF9 1416 aa26.61■■□□□ 1.85
OTUD1-201ENST00000376495 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.58■■□□□ 1.85
OTUD1-201ENST00000376495 NEFLP07196 543 aa26.55■■□□□ 1.84
OTUD1-201ENST00000376495 GRIN2BQ13224 1484 aa26.55■■□□□ 1.84
OTUD1-201ENST00000376495 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.54■■□□□ 1.84
OTUD1-201ENST00000376495 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.53■■□□□ 1.84
OTUD1-201ENST00000376495 CCER2I3L3R5 266 aa26.52■■□□□ 1.84
OTUD1-201ENST00000376495 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.52■■□□□ 1.84
OTUD1-201ENST00000376495 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.5■■□□□ 1.83
OTUD1-201ENST00000376495 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
OTUD1-201ENST00000376495 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.49■■□□□ 1.83
OTUD1-201ENST00000376495 SAMD9Q5K651 1589 aa26.48■■□□□ 1.83
OTUD1-201ENST00000376495 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
OTUD1-201ENST00000376495 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.45■■□□□ 1.83
OTUD1-201ENST00000376495 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
OTUD1-201ENST00000376495 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
OTUD1-201ENST00000376495 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
OTUD1-201ENST00000376495 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
OTUD1-201ENST00000376495 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
OTUD1-201ENST00000376495 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.42■■□□□ 1.82
OTUD1-201ENST00000376495 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.42■■□□□ 1.82
OTUD1-201ENST00000376495 MYT1Q01538 1121 aa26.42■■□□□ 1.82
OTUD1-201ENST00000376495 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.4■■□□□ 1.82
OTUD1-201ENST00000376495 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.39■■□□□ 1.82
OTUD1-201ENST00000376495 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.38■■□□□ 1.81
OTUD1-201ENST00000376495 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
OTUD1-201ENST00000376495 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
OTUD1-201ENST00000376495 CCDC184Q52MB2 194 aa26.35■■□□□ 1.81
OTUD1-201ENST00000376495 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
OTUD1-201ENST00000376495 KDM6BO15054 1643 aa26.33■■□□□ 1.81
OTUD1-201ENST00000376495 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
OTUD1-201ENST00000376495 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
OTUD1-201ENST00000376495 FBLN2P98095 1184 aa26.31■■□□□ 1.8
OTUD1-201ENST00000376495 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
OTUD1-201ENST00000376495 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
OTUD1-201ENST00000376495 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.29■■□□□ 1.8
OTUD1-201ENST00000376495 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.28■■□□□ 1.8
OTUD1-201ENST00000376495 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.28■■□□□ 1.8
OTUD1-201ENST00000376495 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
OTUD1-201ENST00000376495 IQGAP2Q13576 1575 aa26.26■■□□□ 1.79
OTUD1-201ENST00000376495 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
OTUD1-201ENST00000376495 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.26■■□□□ 1.79
OTUD1-201ENST00000376495 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
OTUD1-201ENST00000376495 ARHGEF11O15085 1522 aa26.24■■□□□ 1.79
OTUD1-201ENST00000376495 HECW1Q76N89 1606 aa26.22■■□□□ 1.79
OTUD1-201ENST00000376495 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 696 ms