RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356545.6

RSPO1-201, Transcript of R-spondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RSPO1, Length 2,621 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO1-201ENST00000356545 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
RSPO1-201ENST00000356545 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.04■■■□□ 2.4
RSPO1-201ENST00000356545 WDR97A6NE52 1622 aa30.03■■■□□ 2.4
RSPO1-201ENST00000356545 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
RSPO1-201ENST00000356545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.98■■■□□ 2.39
RSPO1-201ENST00000356545 BCANQ96GW7 911 aa29.95■■■□□ 2.39
RSPO1-201ENST00000356545 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
RSPO1-201ENST00000356545 FKBP8Q14318 412 aa29.89■■■□□ 2.38
RSPO1-201ENST00000356545 P3H3Q8IVL6 736 aa29.88■■■□□ 2.37
RSPO1-201ENST00000356545 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
RSPO1-201ENST00000356545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.84■■■□□ 2.37
RSPO1-201ENST00000356545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.83■■■□□ 2.37
RSPO1-201ENST00000356545 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.82■■■□□ 2.36
RSPO1-201ENST00000356545 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.82■■■□□ 2.36
RSPO1-201ENST00000356545 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
RSPO1-201ENST00000356545 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
RSPO1-201ENST00000356545 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.77■■■□□ 2.36
RSPO1-201ENST00000356545 PRDM2Q13029 1718 aa29.76■■■□□ 2.35
RSPO1-201ENST00000356545 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.76■■■□□ 2.35
RSPO1-201ENST00000356545 TRIM52Q96A61 297 aa29.74■■■□□ 2.35
RSPO1-201ENST00000356545 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.72■■■□□ 2.35
RSPO1-201ENST00000356545 CCER2I3L3R5 266 aa29.72■■■□□ 2.35
RSPO1-201ENST00000356545 ANP32CO43423 234 aa29.68■■■□□ 2.34
RSPO1-201ENST00000356545 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.34
RSPO1-201ENST00000356545 NEFLP07196 543 aa29.62■■■□□ 2.33
RSPO1-201ENST00000356545 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.62■■■□□ 2.33
RSPO1-201ENST00000356545 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.6■■■□□ 2.33
RSPO1-201ENST00000356545 TONSLQ96HA7 1378 aa29.56■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.55■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.53■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 PTPRKQ15262 1439 aa29.53■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.51■■■□□ 2.31
RSPO1-201ENST00000356545 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.51■■■□□ 2.31
RSPO1-201ENST00000356545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.47■■■□□ 2.31
RSPO1-201ENST00000356545 HFM1A2PYH4 1435 aa29.46■■■□□ 2.31
RSPO1-201ENST00000356545 UACAQ9BZF9 1416 aa29.46■■■□□ 2.31
RSPO1-201ENST00000356545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.44■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.42■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.41■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 FMN1Q68DA7 1419 aa29.4■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.39■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 NAIPQ13075 1403 aa29.38■■■□□ 2.29
RSPO1-201ENST00000356545 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.37■■■□□ 2.29
RSPO1-201ENST00000356545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.35■■■□□ 2.29
RSPO1-201ENST00000356545 TOPBP1Q92547 1522 aa29.34■■■□□ 2.29
RSPO1-201ENST00000356545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.32■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.32■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 NCOA2Q15596 1464 aa29.3■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 CUL7Q14999 1698 aa29.3■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.29■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.26■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 MSH5O43196 834 aa29.24■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.24■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 GRIN2BQ13224 1484 aa29.21■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.2■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 SAMD9Q5K651 1589 aa29.18■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 NESP48681 1621 aa29.18■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 BCL11AQ9H165 835 aa29.16■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.16■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 CCDC184Q52MB2 194 aa29.14■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.1■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.1■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.1■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 ARHGEF11O15085 1522 aa29.08■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.05■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.03■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 KDM6BO15054 1643 aa29.03■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.03■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.01■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 GAPVD1Q14C86 1478 aa29■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 FOXD1Q16676 465 aa29■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.99■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 HECW1Q76N89 1606 aa28.99■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.97■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.97■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.96■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 CCDC7Q96M83 1385 aa28.95■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.95■■■□□ 2.22
RSPO1-201ENST00000356545 NCOA1Q15788 1441 aa28.95■■■□□ 2.22
RSPO1-201ENST00000356545 AKNAQ7Z591 1439 aa28.94■■■□□ 2.22
RSPO1-201ENST00000356545 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.9■■■□□ 2.22
RSPO1-201ENST00000356545 MRS2Q9HD23 443 aa28.9■■■□□ 2.22
RSPO1-201ENST00000356545 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.86■■■□□ 2.21
RSPO1-201ENST00000356545 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.85■■■□□ 2.21
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