RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.96■■□□□ 1.75
KRCC1-201ENST00000347055 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
KRCC1-201ENST00000347055 CCER2I3L3R5 266 aa25.9■■□□□ 1.74
KRCC1-201ENST00000347055 WDR97A6NE52 1622 aa25.88■■□□□ 1.73
KRCC1-201ENST00000347055 IGF1RP08069 1367 aa25.86■■□□□ 1.73
KRCC1-201ENST00000347055 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
KRCC1-201ENST00000347055 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
KRCC1-201ENST00000347055 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.8■■□□□ 1.72
KRCC1-201ENST00000347055 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.79■■□□□ 1.72
KRCC1-201ENST00000347055 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.78■■□□□ 1.72
KRCC1-201ENST00000347055 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
KRCC1-201ENST00000347055 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.76■■□□□ 1.71
KRCC1-201ENST00000347055 NEFLP07196 543 aa25.74■■□□□ 1.71
KRCC1-201ENST00000347055 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.71■■□□□ 1.71
KRCC1-201ENST00000347055 ITGAEP38570 1179 aa25.7■■□□□ 1.7
KRCC1-201ENST00000347055 KCNH8Q96L42 1107 aa25.69■■□□□ 1.7
KRCC1-201ENST00000347055 FKBP8Q14318 412 aa25.68■■□□□ 1.7
KRCC1-201ENST00000347055 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.67■■□□□ 1.7
KRCC1-201ENST00000347055 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
KRCC1-201ENST00000347055 ANP32CO43423 234 aa25.65■■□□□ 1.7
KRCC1-201ENST00000347055 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.63■■□□□ 1.69
KRCC1-201ENST00000347055 CUL7Q14999 1698 aa25.61■■□□□ 1.69
KRCC1-201ENST00000347055 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.6■■□□□ 1.69
KRCC1-201ENST00000347055 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.57■■□□□ 1.68
KRCC1-201ENST00000347055 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.57■■□□□ 1.68
KRCC1-201ENST00000347055 UACAQ9BZF9 1416 aa25.57■■□□□ 1.68
KRCC1-201ENST00000347055 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
KRCC1-201ENST00000347055 HFM1A2PYH4 1435 aa25.55■■□□□ 1.68
KRCC1-201ENST00000347055 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.54■■□□□ 1.68
KRCC1-201ENST00000347055 FMN1Q68DA7 1419 aa25.53■■□□□ 1.68
KRCC1-201ENST00000347055 TONSLQ96HA7 1378 aa25.52■■□□□ 1.68
KRCC1-201ENST00000347055 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.52■■□□□ 1.68
KRCC1-201ENST00000347055 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
KRCC1-201ENST00000347055 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.51■■□□□ 1.67
KRCC1-201ENST00000347055 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.51■■□□□ 1.67
KRCC1-201ENST00000347055 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.49■■□□□ 1.67
KRCC1-201ENST00000347055 BCANQ96GW7 911 aa25.49■■□□□ 1.67
KRCC1-201ENST00000347055 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.48■■□□□ 1.67
KRCC1-201ENST00000347055 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.45■■□□□ 1.66
KRCC1-201ENST00000347055 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.43■■□□□ 1.66
KRCC1-201ENST00000347055 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.4■■□□□ 1.66
KRCC1-201ENST00000347055 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.4■■□□□ 1.66
KRCC1-201ENST00000347055 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.39■■□□□ 1.66
KRCC1-201ENST00000347055 SAMD9Q5K651 1589 aa25.39■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.36■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 AKNAQ7Z591 1439 aa25.35■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 HECW1Q76N89 1606 aa25.35■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 NAIPQ13075 1403 aa25.35■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 TRIM52Q96A61 297 aa25.34■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.34■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.34■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 BCL11AQ9H165 835 aa25.33■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 NCOA2Q15596 1464 aa25.33■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.33■■□□□ 1.65
KRCC1-201ENST00000347055 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.3■■□□□ 1.64
KRCC1-201ENST00000347055 ARHGEF11O15085 1522 aa25.3■■□□□ 1.64
KRCC1-201ENST00000347055 GRIN2BQ13224 1484 aa25.29■■□□□ 1.64
KRCC1-201ENST00000347055 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
KRCC1-201ENST00000347055 PTPRKQ15262 1439 aa25.28■■□□□ 1.64
KRCC1-201ENST00000347055 TOPBP1Q92547 1522 aa25.27■■□□□ 1.64
KRCC1-201ENST00000347055 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.64
KRCC1-201ENST00000347055 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.26■■□□□ 1.63
KRCC1-201ENST00000347055 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.25■■□□□ 1.63
KRCC1-201ENST00000347055 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
KRCC1-201ENST00000347055 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.25■■□□□ 1.63
KRCC1-201ENST00000347055 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.21■■□□□ 1.63
KRCC1-201ENST00000347055 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
KRCC1-201ENST00000347055 P3H3Q8IVL6 736 aa25.18■■□□□ 1.62
KRCC1-201ENST00000347055 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
KRCC1-201ENST00000347055 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.17■■□□□ 1.62
KRCC1-201ENST00000347055 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
KRCC1-201ENST00000347055 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.17■■□□□ 1.62
KRCC1-201ENST00000347055 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
KRCC1-201ENST00000347055 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.15■■□□□ 1.62
KRCC1-201ENST00000347055 MSH5O43196 834 aa25.11■■□□□ 1.61
KRCC1-201ENST00000347055 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.11■■□□□ 1.61
KRCC1-201ENST00000347055 NCOA1Q15788 1441 aa25.1■■□□□ 1.61
KRCC1-201ENST00000347055 MIA2Q96PC5 1412 aa25.1■■□□□ 1.61
KRCC1-201ENST00000347055 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
KRCC1-201ENST00000347055 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
KRCC1-201ENST00000347055 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
KRCC1-201ENST00000347055 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.05■■□□□ 1.6
KRCC1-201ENST00000347055 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.05■■□□□ 1.6
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC7Q96M83 1385 aa25.01■■□□□ 1.59
KRCC1-201ENST00000347055 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.01■■□□□ 1.59
KRCC1-201ENST00000347055 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.99■■□□□ 1.59
KRCC1-201ENST00000347055 ROCK1Q13464 1354 aa24.97■■□□□ 1.59
KRCC1-201ENST00000347055 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.97■■□□□ 1.59
KRCC1-201ENST00000347055 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
KRCC1-201ENST00000347055 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
KRCC1-201ENST00000347055 NESP48681 1621 aa24.93■■□□□ 1.58
KRCC1-201ENST00000347055 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.92■■□□□ 1.58
KRCC1-201ENST00000347055 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
KRCC1-201ENST00000347055 KDM6BO15054 1643 aa24.91■■□□□ 1.58
KRCC1-201ENST00000347055 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.9■■□□□ 1.58
KRCC1-201ENST00000347055 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
KRCC1-201ENST00000347055 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.88■■□□□ 1.57
KRCC1-201ENST00000347055 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
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