RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.12■■□□□ 1.77
PKP3-201ENST00000331563 APLP2Q06481 763 aa26.12■■□□□ 1.77
PKP3-201ENST00000331563 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PKP3-201ENST00000331563 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.11■■□□□ 1.77
PKP3-201ENST00000331563 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.09■■□□□ 1.77
PKP3-201ENST00000331563 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.08■■□□□ 1.77
PKP3-201ENST00000331563 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PKP3-201ENST00000331563 P3H3Q8IVL6 736 aa26.04■■□□□ 1.76
PKP3-201ENST00000331563 ARAP1Q96P48 1450 aa26.03■■□□□ 1.76
PKP3-201ENST00000331563 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PKP3-201ENST00000331563 FKBP8Q14318 412 aa25.95■■□□□ 1.74
PKP3-201ENST00000331563 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.95■■□□□ 1.74
PKP3-201ENST00000331563 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.93■■□□□ 1.74
PKP3-201ENST00000331563 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PKP3-201ENST00000331563 KCNH8Q96L42 1107 aa25.87■■□□□ 1.73
PKP3-201ENST00000331563 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PKP3-201ENST00000331563 NEFLP07196 543 aa25.82■■□□□ 1.72
PKP3-201ENST00000331563 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.77■■□□□ 1.72
PKP3-201ENST00000331563 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PKP3-201ENST00000331563 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.712e-6■■■■□ 19.6
PKP3-201ENST00000331563 WDR97A6NE52 1622 aa25.73■■□□□ 1.71
PKP3-201ENST00000331563 ITGAEP38570 1179 aa25.73■■□□□ 1.71
PKP3-201ENST00000331563 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.72■■□□□ 1.71
PKP3-201ENST00000331563 ERCC6Q03468 1493 aa25.71■■□□□ 1.71
PKP3-201ENST00000331563 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.7■■□□□ 1.7
PKP3-201ENST00000331563 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PKP3-201ENST00000331563 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.66■■□□□ 1.7
PKP3-201ENST00000331563 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PKP3-201ENST00000331563 CUL7Q14999 1698 aa25.6■■□□□ 1.69
PKP3-201ENST00000331563 MSH5O43196 834 aa25.6■■□□□ 1.69
PKP3-201ENST00000331563 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PKP3-201ENST00000331563 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PKP3-201ENST00000331563 TRIM52Q96A61 297 aa25.54■■□□□ 1.68
PKP3-201ENST00000331563 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.52■■□□□ 1.68
PKP3-201ENST00000331563 WDR62O43379 1518 aa25.51■■□□□ 1.67
PKP3-201ENST00000331563 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.48■■□□□ 1.67
PKP3-201ENST00000331563 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PKP3-201ENST00000331563 ARID3CA6NKF2 412 aa25.46■■□□□ 1.67
PKP3-201ENST00000331563 PBRM1Q86U86 1689 aa25.46■■□□□ 1.67
PKP3-201ENST00000331563 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.46■■□□□ 1.67
PKP3-201ENST00000331563 TIAM1Q13009 1591 aa25.44■■□□□ 1.66
PKP3-201ENST00000331563 FBLN2P98095 1184 aa25.44■■□□□ 1.66
PKP3-201ENST00000331563 IFT140Q96RY7 1462 aa25.42■■□□□ 1.66
PKP3-201ENST00000331563 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.41■■□□□ 1.66
PKP3-201ENST00000331563 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.4■■□□□ 1.66
PKP3-201ENST00000331563 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PKP3-201ENST00000331563 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PKP3-201ENST00000331563 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PKP3-201ENST00000331563 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.39■■□□□ 1.66
PKP3-201ENST00000331563 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
PKP3-201ENST00000331563 GRIN2BQ13224 1484 aa25.39■■□□□ 1.65
PKP3-201ENST00000331563 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.37■■□□□ 1.65
PKP3-201ENST00000331563 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PKP3-201ENST00000331563 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.35■■□□□ 1.65
PKP3-201ENST00000331563 ANP32CO43423 234 aa25.32■■□□□ 1.64
PKP3-201ENST00000331563 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PKP3-201ENST00000331563 ADAMTS12P58397 1594 aa25.32■■□□□ 1.64
PKP3-201ENST00000331563 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.32■■□□□ 1.64
PKP3-201ENST00000331563 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.32■■□□□ 1.64
PKP3-201ENST00000331563 FMN1Q68DA7 1419 aa25.3■■□□□ 1.64
PKP3-201ENST00000331563 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PKP3-201ENST00000331563 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.28■■□□□ 1.64
PKP3-201ENST00000331563 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PKP3-201ENST00000331563 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PKP3-201ENST00000331563 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PKP3-201ENST00000331563 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.25■■□□□ 1.63
PKP3-201ENST00000331563 SAMD9Q5K651 1589 aa25.25■■□□□ 1.63
PKP3-201ENST00000331563 MAP3K1Q13233 1512 aa25.24■■□□□ 1.63
PKP3-201ENST00000331563 CCER2I3L3R5 266 aa25.23■■□□□ 1.63
PKP3-201ENST00000331563 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.23■■□□□ 1.63
PKP3-201ENST00000331563 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PKP3-201ENST00000331563 IQGAP2Q13576 1575 aa25.21■■□□□ 1.63
PKP3-201ENST00000331563 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.2■■□□□ 1.62
PKP3-201ENST00000331563 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.18■■□□□ 1.62
PKP3-201ENST00000331563 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.17■■□□□ 1.62
PKP3-201ENST00000331563 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.17■■□□□ 1.62
PKP3-201ENST00000331563 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.17■■□□□ 1.62
PKP3-201ENST00000331563 GRIN2AQ12879 1464 aa25.14■■□□□ 1.62
PKP3-201ENST00000331563 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
PKP3-201ENST00000331563 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.08■■□□□ 1.61
PKP3-201ENST00000331563 MAPKBP1O60336 1514 aa25.07■■□□□ 1.6
PKP3-201ENST00000331563 NBR1Q14596 966 aa25.07■■□□□ 1.6
PKP3-201ENST00000331563 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PKP3-201ENST00000331563 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.06■■□□□ 1.6
PKP3-201ENST00000331563 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.04■■□□□ 1.6
PKP3-201ENST00000331563 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PKP3-201ENST00000331563 SYNJ2O15056 1496 aa25.03■■□□□ 1.6
PKP3-201ENST00000331563 DISP1Q96F81 1524 aa25.03■■□□□ 1.6
PKP3-201ENST00000331563 NCOA2Q15596 1464 aa25.02■■□□□ 1.6
PKP3-201ENST00000331563 CEP170Q5SW79 1584 aa25.01■■□□□ 1.59
PKP3-201ENST00000331563 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.01■■□□□ 1.59
PKP3-201ENST00000331563 JPH4Q96JJ6 628 aa25.01■■□□□ 1.59
PKP3-201ENST00000331563 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.99■■□□□ 1.59
PKP3-201ENST00000331563 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.98■■□□□ 1.59
PKP3-201ENST00000331563 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PKP3-201ENST00000331563 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.97■■□□□ 1.59
PKP3-201ENST00000331563 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.96■■□□□ 1.59
PKP3-201ENST00000331563 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PKP3-201ENST00000331563 PTPRKQ15262 1439 aa24.94■■□□□ 1.58
PKP3-201ENST00000331563 KIAA0556O60303 1618 aa24.93■■□□□ 1.58
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