RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328834.9

CNOT10-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT10, Length 2,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-201ENST00000328834 HMGXB3Q12766 1538 aa21.37■■□□□ 1.01
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CNOT10-201ENST00000328834 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.31■■□□□ 1
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CNOT10-201ENST00000328834 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.28■■□□□ 1
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CNOT10-201ENST00000328834 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.92■□□□□ 0.94
CNOT10-201ENST00000328834 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.92■□□□□ 0.94
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CNOT10-201ENST00000328834 MYT1Q01538 1121 aa20.87■□□□□ 0.93
CNOT10-201ENST00000328834 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.87■□□□□ 0.93
CNOT10-201ENST00000328834 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.86■□□□□ 0.93
CNOT10-201ENST00000328834 NEFLP07196 543 aa20.86■□□□□ 0.93
CNOT10-201ENST00000328834 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.85■□□□□ 0.93
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CNOT10-201ENST00000328834 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.69■□□□□ 0.9
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CNOT10-201ENST00000328834 CUL7Q14999 1698 aa20.68■□□□□ 0.9
CNOT10-201ENST00000328834 GRIN2BQ13224 1484 aa20.68■□□□□ 0.9
CNOT10-201ENST00000328834 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.68■□□□□ 0.9
CNOT10-201ENST00000328834 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
CNOT10-201ENST00000328834 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
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CNOT10-201ENST00000328834 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CNOT10-201ENST00000328834 SAMD9Q5K651 1589 aa20.61■□□□□ 0.89
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CNOT10-201ENST00000328834 MRS2Q9HD23 443 aa20.55■□□□□ 0.88
CNOT10-201ENST00000328834 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.55■□□□□ 0.88
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CNOT10-201ENST00000328834 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.53■□□□□ 0.88
CNOT10-201ENST00000328834 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CNOT10-201ENST00000328834 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.52■□□□□ 0.88
CNOT10-201ENST00000328834 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CNOT10-201ENST00000328834 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.52■□□□□ 0.87
CNOT10-201ENST00000328834 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CNOT10-201ENST00000328834 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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