RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLIP1P30622 1438 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR97A6NE52 1622 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FKBP8Q14318 412 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BCANQ96GW7 911 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERCC6Q03468 1493 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC2L-201ENST00000301021 APLP2Q06481 763 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR62O43379 1518 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NEFLP07196 543 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KCNH8Q96L42 1107 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC2L-201ENST00000301021 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CUL7Q14999 1698 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MSH5O43196 834 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IFT140Q96RY7 1462 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.647e-7■■■□□ 15.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARAP1Q96P48 1450 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PBRM1Q86U86 1689 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GRIN2BQ13224 1484 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCER2I3L3R5 266 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ITGAEP38570 1179 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADAMTS12P58397 1594 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAPKBP1O60336 1514 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 P3H3Q8IVL6 736 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIM52Q96A61 297 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANP32CO43423 234 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SAMD9Q5K651 1589 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GRIN2AQ12879 1464 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IQGAP2Q13576 1575 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYNJ2O15056 1496 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FBLN2P98095 1184 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FMN1Q68DA7 1419 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAP3K1Q13233 1512 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TIAM1Q13009 1591 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEP170Q5SW79 1584 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUP160Q12769 1436 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DISP1Q96F81 1524 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIAA0556O60303 1618 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC2L-201ENST00000301021 JPH4Q96JJ6 628 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NBR1Q14596 966 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHD1O14646 1710 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HECW1Q76N89 1606 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TONSLQ96HA7 1378 aa24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms