RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299335.7

COX11-201, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX11, Length 2,497 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11-201ENST00000299335 P3H3Q8IVL6 736 aa22.43■■□□□ 1.18
COX11-201ENST00000299335 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.41■■□□□ 1.18
COX11-201ENST00000299335 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
COX11-201ENST00000299335 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
COX11-201ENST00000299335 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.37■■□□□ 1.17
COX11-201ENST00000299335 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
COX11-201ENST00000299335 KCNH8Q96L42 1107 aa22.35■■□□□ 1.17
COX11-201ENST00000299335 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
COX11-201ENST00000299335 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.34■■□□□ 1.17
COX11-201ENST00000299335 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.32■■□□□ 1.16
COX11-201ENST00000299335 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.31■■□□□ 1.16
COX11-201ENST00000299335 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.31■■□□□ 1.16
COX11-201ENST00000299335 MYT1Q01538 1121 aa22.3■■□□□ 1.16
COX11-201ENST00000299335 WDR97A6NE52 1622 aa22.3■■□□□ 1.16
COX11-201ENST00000299335 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
COX11-201ENST00000299335 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.25■■□□□ 1.15
COX11-201ENST00000299335 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.25■■□□□ 1.15
COX11-201ENST00000299335 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.24■■□□□ 1.15
COX11-201ENST00000299335 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.24■■□□□ 1.15
COX11-201ENST00000299335 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
COX11-201ENST00000299335 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.23■■□□□ 1.15
COX11-201ENST00000299335 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.23■■□□□ 1.15
COX11-201ENST00000299335 TOPBP1Q92547 1522 aa22.21■■□□□ 1.15
COX11-201ENST00000299335 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
COX11-201ENST00000299335 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.2■■□□□ 1.14
COX11-201ENST00000299335 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.147e-6■■□□□ 13.1
COX11-201ENST00000299335 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
COX11-201ENST00000299335 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
COX11-201ENST00000299335 NESP48681 1621 aa22.15■■□□□ 1.14
COX11-201ENST00000299335 FMN1Q68DA7 1419 aa22.12■■□□□ 1.13
COX11-201ENST00000299335 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.12■■□□□ 1.13
COX11-201ENST00000299335 CUL7Q14999 1698 aa22.12■■□□□ 1.13
COX11-201ENST00000299335 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.09■■□□□ 1.13
COX11-201ENST00000299335 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.08■■□□□ 1.13
COX11-201ENST00000299335 PTPRKQ15262 1439 aa22.07■■□□□ 1.12
COX11-201ENST00000299335 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.07■■□□□ 1.12
COX11-201ENST00000299335 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.06■■□□□ 1.12
COX11-201ENST00000299335 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.04■■□□□ 1.12
COX11-201ENST00000299335 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
COX11-201ENST00000299335 TONSLQ96HA7 1378 aa22.03■■□□□ 1.12
COX11-201ENST00000299335 HFM1A2PYH4 1435 aa22.02■■□□□ 1.12
COX11-201ENST00000299335 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 UACAQ9BZF9 1416 aa22■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 CCER2I3L3R5 266 aa22■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 ANP32CO43423 234 aa22■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 BCANQ96GW7 911 aa21.98■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 FKBP8Q14318 412 aa21.98■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 NCOA2Q15596 1464 aa21.98■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 SAMD9Q5K651 1589 aa21.97■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.96■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 NAIPQ13075 1403 aa21.96■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.96■■□□□ 1.11
COX11-201ENST00000299335 GRIN2BQ13224 1484 aa21.95■■□□□ 1.1
COX11-201ENST00000299335 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.94■■□□□ 1.1
COX11-201ENST00000299335 TRIM52Q96A61 297 aa21.94■■□□□ 1.1
COX11-201ENST00000299335 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.94■■□□□ 1.1
COX11-201ENST00000299335 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.92■■□□□ 1.1
COX11-201ENST00000299335 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.9■■□□□ 1.1
COX11-201ENST00000299335 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
COX11-201ENST00000299335 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.86■■□□□ 1.09
COX11-201ENST00000299335 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
COX11-201ENST00000299335 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.85■■□□□ 1.09
COX11-201ENST00000299335 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.85■■□□□ 1.09
COX11-201ENST00000299335 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.84■■□□□ 1.09
COX11-201ENST00000299335 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.84■■□□□ 1.09
COX11-201ENST00000299335 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.83■■□□□ 1.08
COX11-201ENST00000299335 ARHGEF11O15085 1522 aa21.82■■□□□ 1.08
COX11-201ENST00000299335 NEFLP07196 543 aa21.82■■□□□ 1.08
COX11-201ENST00000299335 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.8■■□□□ 1.08
COX11-201ENST00000299335 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.78■■□□□ 1.08
COX11-201ENST00000299335 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
COX11-201ENST00000299335 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
COX11-201ENST00000299335 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
COX11-201ENST00000299335 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.73■■□□□ 1.07
COX11-201ENST00000299335 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
COX11-201ENST00000299335 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.7■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 KDM6BO15054 1643 aa21.69■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.69■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 AKNAQ7Z591 1439 aa21.68■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 HECW1Q76N89 1606 aa21.68■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 ARID3CA6NKF2 412 aa21.68■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.68■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.67■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 MIA2Q96PC5 1412 aa21.66■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 FOXD1Q16676 465 aa21.65■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.65■■□□□ 1.06
COX11-201ENST00000299335 IQGAP2Q13576 1575 aa21.64■■□□□ 1.05
COX11-201ENST00000299335 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
COX11-201ENST00000299335 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
COX11-201ENST00000299335 WDR62O43379 1518 aa21.59■■□□□ 1.05
COX11-201ENST00000299335 PBRM1Q86U86 1689 aa21.58■■□□□ 1.05
COX11-201ENST00000299335 CCDC184Q52MB2 194 aa21.57■■□□□ 1.04
COX11-201ENST00000299335 ADAMTS12P58397 1594 aa21.56■■□□□ 1.04
COX11-201ENST00000299335 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.56■■□□□ 1.04
COX11-201ENST00000299335 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.54■■□□□ 1.04
COX11-201ENST00000299335 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.54■■□□□ 1.04
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