RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WDR97A6NE52 1622 aa13.14□□□□□ -0.31
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.12□□□□□ -0.31
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ADCY10Q96PN6 1610 aa12.5□□□□□ -0.41
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SAMD9Q5K651 1589 aa12.49□□□□□ -0.41
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 P3H3Q8IVL6 736 aa12.48□□□□□ -0.41
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.45□□□□□ -0.42
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.44□□□□□ -0.42
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.44□□□□□ -0.42
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.42
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ABCA8O94911 1581 aa12.43□□□□□ -0.42
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.42□□□□□ -0.42
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.41□□□□□ -0.42
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 POTEGQ6S5H5 508 aa12.41□□□□□ -0.42
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MYT1Q01538 1121 aa12.39□□□□□ -0.43
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.38□□□□□ -0.43
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ASXL2Q76L83 1435 aa12.36□□□□□ -0.43
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ABCC10Q5T3U5 1492 aa12.36□□□□□ -0.43
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
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