RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 MYT1Q01538 1121 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4A-201ENST00000293683 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PDE4A-201ENST00000293683 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.94■■□□□ 1.58
PDE4A-201ENST00000293683 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.93■■□□□ 1.58
PDE4A-201ENST00000293683 MAP3K1Q13233 1512 aa24.92■■□□□ 1.58
PDE4A-201ENST00000293683 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.9■■□□□ 1.58
PDE4A-201ENST00000293683 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PDE4A-201ENST00000293683 WDR97A6NE52 1622 aa24.88■■□□□ 1.57
PDE4A-201ENST00000293683 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PDE4A-201ENST00000293683 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
PDE4A-201ENST00000293683 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.81■■□□□ 1.56
PDE4A-201ENST00000293683 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.81■■□□□ 1.56
PDE4A-201ENST00000293683 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.8■■□□□ 1.56
PDE4A-201ENST00000293683 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PDE4A-201ENST00000293683 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.73■■□□□ 1.55
PDE4A-201ENST00000293683 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.72■■□□□ 1.55
PDE4A-201ENST00000293683 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.7■■□□□ 1.54
PDE4A-201ENST00000293683 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.7■■□□□ 1.54
PDE4A-201ENST00000293683 BCANQ96GW7 911 aa24.69■■□□□ 1.54
PDE4A-201ENST00000293683 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PDE4A-201ENST00000293683 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.65■■□□□ 1.54
PDE4A-201ENST00000293683 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.62■■□□□ 1.53
PDE4A-201ENST00000293683 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PDE4A-201ENST00000293683 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.59■■□□□ 1.53
PDE4A-201ENST00000293683 FKBP8Q14318 412 aa24.59■■□□□ 1.53
PDE4A-201ENST00000293683 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.58■■□□□ 1.53
PDE4A-201ENST00000293683 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.58■■□□□ 1.53
PDE4A-201ENST00000293683 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.57■■□□□ 1.52
PDE4A-201ENST00000293683 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.57■■□□□ 1.52
PDE4A-201ENST00000293683 TOPBP1Q92547 1522 aa24.57■■□□□ 1.52
PDE4A-201ENST00000293683 TRIM52Q96A61 297 aa24.55■■□□□ 1.52
PDE4A-201ENST00000293683 PTPRKQ15262 1439 aa24.54■■□□□ 1.52
PDE4A-201ENST00000293683 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.522e-6■■■□□ 17.2
PDE4A-201ENST00000293683 NESP48681 1621 aa24.54■■□□□ 1.52
PDE4A-201ENST00000293683 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.527e-6■■■□□ 16.5
PDE4A-201ENST00000293683 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.52■■□□□ 1.52
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.52■■□□□ 1.52
PDE4A-201ENST00000293683 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.51■■□□□ 1.51
PDE4A-201ENST00000293683 TONSLQ96HA7 1378 aa24.49■■□□□ 1.51
PDE4A-201ENST00000293683 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.49■■□□□ 1.51
PDE4A-201ENST00000293683 ANP32CO43423 234 aa24.49■■□□□ 1.51
PDE4A-201ENST00000293683 CUL7Q14999 1698 aa24.48■■□□□ 1.51
PDE4A-201ENST00000293683 FMN1Q68DA7 1419 aa24.48■■□□□ 1.51
PDE4A-201ENST00000293683 CCER2I3L3R5 266 aa24.45■■□□□ 1.5
PDE4A-201ENST00000293683 HFM1A2PYH4 1435 aa24.44■■□□□ 1.5
PDE4A-201ENST00000293683 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.44■■□□□ 1.5
PDE4A-201ENST00000293683 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.43■■□□□ 1.5
PDE4A-201ENST00000293683 UACAQ9BZF9 1416 aa24.42■■□□□ 1.5
PDE4A-201ENST00000293683 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PDE4A-201ENST00000293683 NCOA2Q15596 1464 aa24.4■■□□□ 1.5
PDE4A-201ENST00000293683 NAIPQ13075 1403 aa24.39■■□□□ 1.5
PDE4A-201ENST00000293683 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.36■■□□□ 1.49
PDE4A-201ENST00000293683 NEFLP07196 543 aa24.35■■□□□ 1.49
PDE4A-201ENST00000293683 SAMD9Q5K651 1589 aa24.35■■□□□ 1.49
PDE4A-201ENST00000293683 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PDE4A-201ENST00000293683 GRIN2BQ13224 1484 aa24.34■■□□□ 1.49
PDE4A-201ENST00000293683 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.33■■□□□ 1.49
PDE4A-201ENST00000293683 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.3■■□□□ 1.48
PDE4A-201ENST00000293683 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.3■■□□□ 1.48
PDE4A-201ENST00000293683 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.29■■□□□ 1.48
PDE4A-201ENST00000293683 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.28■■□□□ 1.48
PDE4A-201ENST00000293683 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.28■■□□□ 1.48
PDE4A-201ENST00000293683 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.27■■□□□ 1.48
PDE4A-201ENST00000293683 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PDE4A-201ENST00000293683 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.26■■□□□ 1.47
PDE4A-201ENST00000293683 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.24■■□□□ 1.47
PDE4A-201ENST00000293683 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.23■■□□□ 1.47
PDE4A-201ENST00000293683 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PDE4A-201ENST00000293683 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PDE4A-201ENST00000293683 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.2■■□□□ 1.47
PDE4A-201ENST00000293683 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
PDE4A-201ENST00000293683 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PDE4A-201ENST00000293683 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGEF11O15085 1522 aa24.18■■□□□ 1.46
PDE4A-201ENST00000293683 KDM6BO15054 1643 aa24.18■■□□□ 1.46
PDE4A-201ENST00000293683 ARID3CA6NKF2 412 aa24.16■■□□□ 1.46
PDE4A-201ENST00000293683 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PDE4A-201ENST00000293683 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.15■■□□□ 1.46
PDE4A-201ENST00000293683 FOXD1Q16676 465 aa24.13■■□□□ 1.45
PDE4A-201ENST00000293683 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.11■■□□□ 1.45
PDE4A-201ENST00000293683 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC184Q52MB2 194 aa24.1■■□□□ 1.45
PDE4A-201ENST00000293683 HECW1Q76N89 1606 aa24.09■■□□□ 1.45
PDE4A-201ENST00000293683 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PDE4A-201ENST00000293683 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.06■■□□□ 1.44
PDE4A-201ENST00000293683 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.06■■□□□ 1.44
PDE4A-201ENST00000293683 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PDE4A-201ENST00000293683 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.447e-8■■■■■ 74.7
PDE4A-201ENST00000293683 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PDE4A-201ENST00000293683 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.05■■□□□ 1.44
PDE4A-201ENST00000293683 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.04■■□□□ 1.44
PDE4A-201ENST00000293683 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PDE4A-201ENST00000293683 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.01■■□□□ 1.43
PDE4A-201ENST00000293683 AKNAQ7Z591 1439 aa23.99■■□□□ 1.43
PDE4A-201ENST00000293683 IQGAP2Q13576 1575 aa23.97■■□□□ 1.43
PDE4A-201ENST00000293683 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.96■■□□□ 1.43
PDE4A-201ENST00000293683 MSH5O43196 834 aa23.95■■□□□ 1.42
PDE4A-201ENST00000293683 MIA2Q96PC5 1412 aa23.95■■□□□ 1.42
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC7Q96M83 1385 aa23.95■■□□□ 1.42
PDE4A-201ENST00000293683 WDR62O43379 1518 aa23.94■■□□□ 1.42
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