RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262435.13

SMURF2-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2-201ENST00000262435 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF2-201ENST00000262435 BCANQ96GW7 911 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF2-201ENST00000262435 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF2-201ENST00000262435 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.62■■□□□ 1.21
SMURF2-201ENST00000262435 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF2-201ENST00000262435 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF2-201ENST00000262435 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF2-201ENST00000262435 MAPKBP1O60336 1514 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF2-201ENST00000262435 TIAM1Q13009 1591 aa22.55■■□□□ 1.2
SMURF2-201ENST00000262435 TRIM52Q96A61 297 aa22.5■■□□□ 1.19
SMURF2-201ENST00000262435 WDR97A6NE52 1622 aa22.5■■□□□ 1.19
SMURF2-201ENST00000262435 ARID3CA6NKF2 412 aa22.49■■□□□ 1.19
SMURF2-201ENST00000262435 NESP48681 1621 aa22.47■■□□□ 1.19
SMURF2-201ENST00000262435 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.47■■□□□ 1.19
SMURF2-201ENST00000262435 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.43■■□□□ 1.18
SMURF2-201ENST00000262435 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SMURF2-201ENST00000262435 FKBP8Q14318 412 aa22.43■■□□□ 1.18
SMURF2-201ENST00000262435 MYT1Q01538 1121 aa22.42■■□□□ 1.18
SMURF2-201ENST00000262435 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SMURF2-201ENST00000262435 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.41■■□□□ 1.18
SMURF2-201ENST00000262435 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.41■■□□□ 1.18
SMURF2-201ENST00000262435 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
SMURF2-201ENST00000262435 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF2-201ENST00000262435 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.36■■□□□ 1.17
SMURF2-201ENST00000262435 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF2-201ENST00000262435 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SMURF2-201ENST00000262435 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF2-201ENST00000262435 TONSLQ96HA7 1378 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF2-201ENST00000262435 ANP32CO43423 234 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF2-201ENST00000262435 MAP3K1Q13233 1512 aa22.29■■□□□ 1.16
SMURF2-201ENST00000262435 PTPRKQ15262 1439 aa22.29■■□□□ 1.16
SMURF2-201ENST00000262435 TOPBP1Q92547 1522 aa22.28■■□□□ 1.16
SMURF2-201ENST00000262435 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF2-201ENST00000262435 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF2-201ENST00000262435 FOXD1Q16676 465 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF2-201ENST00000262435 PRDM2Q13029 1718 aa22.22■■□□□ 1.15
SMURF2-201ENST00000262435 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.21■■□□□ 1.15
SMURF2-201ENST00000262435 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.2■■□□□ 1.14
SMURF2-201ENST00000262435 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMURF2-201ENST00000262435 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF2-201ENST00000262435 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SMURF2-201ENST00000262435 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF2-201ENST00000262435 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF2-201ENST00000262435 NEFLP07196 543 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF2-201ENST00000262435 FMN1Q68DA7 1419 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF2-201ENST00000262435 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 30.3
SMURF2-201ENST00000262435 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.14■■□□□ 1.14
SMURF2-201ENST00000262435 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMURF2-201ENST00000262435 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SMURF2-201ENST00000262435 NCOA2Q15596 1464 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF2-201ENST00000262435 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.1■■□□□ 1.13
SMURF2-201ENST00000262435 NAIPQ13075 1403 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF2-201ENST00000262435 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMURF2-201ENST00000262435 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF2-201ENST00000262435 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF2-201ENST00000262435 CCER2I3L3R5 266 aa22.06■■□□□ 1.12
SMURF2-201ENST00000262435 UACAQ9BZF9 1416 aa22.06■■□□□ 1.12
SMURF2-201ENST00000262435 HFM1A2PYH4 1435 aa22.06■■□□□ 1.12
SMURF2-201ENST00000262435 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.04■■□□□ 1.12
SMURF2-201ENST00000262435 CCDC184Q52MB2 194 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF2-201ENST00000262435 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.02■■□□□ 1.12
SMURF2-201ENST00000262435 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.01■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.98■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 CUL7Q14999 1698 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF2-201ENST00000262435 GRIN2BQ13224 1484 aa21.95■■□□□ 1.1
SMURF2-201ENST00000262435 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SMURF2-201ENST00000262435 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.94■■□□□ 1.1
SMURF2-201ENST00000262435 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SMURF2-201ENST00000262435 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SMURF2-201ENST00000262435 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.89■■□□□ 1.09
SMURF2-201ENST00000262435 KDM6BO15054 1643 aa21.88■■□□□ 1.09
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SMURF2-201ENST00000262435 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.87■■□□□ 1.09
SMURF2-201ENST00000262435 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.87■■□□□ 1.09
SMURF2-201ENST00000262435 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SMURF2-201ENST00000262435 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SMURF2-201ENST00000262435 SAMD9Q5K651 1589 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF2-201ENST00000262435 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.84■■□□□ 1.09
SMURF2-201ENST00000262435 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SMURF2-201ENST00000262435 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.82■■□□□ 1.08
SMURF2-201ENST00000262435 MRS2Q9HD23 443 aa21.82■■□□□ 1.08
SMURF2-201ENST00000262435 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.82■■□□□ 1.08
SMURF2-201ENST00000262435 FBLN2P98095 1184 aa21.81■■□□□ 1.08
SMURF2-201ENST00000262435 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.81■■□□□ 1.08
SMURF2-201ENST00000262435 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.8■■□□□ 1.08
SMURF2-201ENST00000262435 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SMURF2-201ENST00000262435 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SMURF2-201ENST00000262435 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SMURF2-201ENST00000262435 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.73■■□□□ 1.07
SMURF2-201ENST00000262435 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.72■■□□□ 1.07
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