RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.4■■■□□ 2.46
CSNK1G2-201ENST00000255641 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRXQ9BXM0 1461 aa30.38■■■□□ 2.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM52Q96A61 297 aa30.37■■■□□ 2.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.34■■■□□ 2.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRDM2Q13029 1718 aa30.33■■■□□ 2.45
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGF1RP08069 1367 aa30.29■■■□□ 2.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAPKBP1O60336 1514 aa30.26■■■□□ 2.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.25■■■□□ 2.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 P3H3Q8IVL6 736 aa30.23■■■□□ 2.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.22■■■□□ 2.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR97A6NE52 1622 aa30.21■■■□□ 2.43
CSNK1G2-201ENST00000255641 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.17■■■□□ 2.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 TOPBP1Q92547 1522 aa30.16■■■□□ 2.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCL11AQ9H165 835 aa30.1■■■□□ 2.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.09■■■□□ 2.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 NEFLP07196 543 aa30.08■■■□□ 2.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.07■■■□□ 2.4
CSNK1G2-201ENST00000255641 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CSNK1G2-201ENST00000255641 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.06■■■□□ 2.4
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30■■■□□ 2.39
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANP32CO43423 234 aa29.97■■■□□ 2.39
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.97■■■□□ 2.39
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.93■■■□□ 2.38
CSNK1G2-201ENST00000255641 MSH5O43196 834 aa29.89■■■□□ 2.38
CSNK1G2-201ENST00000255641 TIAM1Q13009 1591 aa29.89■■■□□ 2.38
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.89■■■□□ 2.38
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.87■■■□□ 2.37
CSNK1G2-201ENST00000255641 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCER2I3L3R5 266 aa29.77■■■□□ 2.36
CSNK1G2-201ENST00000255641 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.75■■■□□ 2.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.72■■■□□ 2.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 TONSLQ96HA7 1378 aa29.72■■■□□ 2.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.355e-9■■■□□ 17.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC184Q52MB2 194 aa29.61■■■□□ 2.33
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARID3CA6NKF2 412 aa29.57■■■□□ 2.32
CSNK1G2-201ENST00000255641 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.56■■■□□ 2.32
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTPRKQ15262 1439 aa29.54■■■□□ 2.32
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.54■■■□□ 2.32
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAP3K1Q13233 1512 aa29.54■■■□□ 2.32
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CSNK1G2-201ENST00000255641 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.52■■■□□ 2.32
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.52■■■□□ 2.32
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERCC6Q03468 1493 aa29.51■■■□□ 2.31
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.51■■■□□ 2.31
CSNK1G2-201ENST00000255641 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
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CSNK1G2-201ENST00000255641 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.49■■■□□ 2.31
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.49■■■□□ 2.31
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.49■■■□□ 2.31
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CSNK1G2-201ENST00000255641 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.47■■■□□ 2.31
CSNK1G2-201ENST00000255641 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.47■■■□□ 2.31
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.47■■■□□ 2.31
CSNK1G2-201ENST00000255641 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.45■■■□□ 2.3
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBLN2P98095 1184 aa29.43■■■□□ 2.3
CSNK1G2-201ENST00000255641 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.42■■■□□ 2.3
CSNK1G2-201ENST00000255641 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.42■■■□□ 2.3
CSNK1G2-201ENST00000255641 FOXD1Q16676 465 aa29.41■■■□□ 2.3
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.4■■■□□ 2.3
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CSNK1G2-201ENST00000255641 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.34■■■□□ 2.29
CSNK1G2-201ENST00000255641 UACAQ9BZF9 1416 aa29.33■■■□□ 2.29
CSNK1G2-201ENST00000255641 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.3■■■□□ 2.28
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAIPQ13075 1403 aa29.29■■■□□ 2.28
CSNK1G2-201ENST00000255641 PBRM1Q86U86 1689 aa29.28■■■□□ 2.28
CSNK1G2-201ENST00000255641 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.28■■■□□ 2.28
CSNK1G2-201ENST00000255641 HFM1A2PYH4 1435 aa29.27■■■□□ 2.28
CSNK1G2-201ENST00000255641 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.27■■■□□ 2.28
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRS2Q9HD23 443 aa29.26■■■□□ 2.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.26■■■□□ 2.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.25■■■□□ 2.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.25■■■□□ 2.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRIN2BQ13224 1484 aa29.24■■■□□ 2.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 FMN1Q68DA7 1419 aa29.23■■■□□ 2.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.21■■■□□ 2.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR62O43379 1518 aa29.21■■■□□ 2.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFT140Q96RY7 1462 aa29.21■■■□□ 2.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 NBR1Q14596 966 aa29.2■■■□□ 2.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.2■■■□□ 2.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.19■■■□□ 2.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.263e-6■■■■■ 31.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.17■■■□□ 2.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCOA2Q15596 1464 aa29.16■■■□□ 2.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAMTS12P58397 1594 aa29.16■■■□□ 2.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CSNK1G2-201ENST00000255641 SAMD9Q5K651 1589 aa29.12■■■□□ 2.25
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