RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.25■■□□□ 1.79
LRP3-201ENST00000253193 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
LRP3-201ENST00000253193 ARID3CA6NKF2 412 aa26.23■■□□□ 1.79
LRP3-201ENST00000253193 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.19■■□□□ 1.78
LRP3-201ENST00000253193 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.19■■□□□ 1.78
LRP3-201ENST00000253193 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.15■■□□□ 1.78
LRP3-201ENST00000253193 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.14■■□□□ 1.78
LRP3-201ENST00000253193 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.14■■□□□ 1.77
LRP3-201ENST00000253193 NEFLP07196 543 aa26.14■■□□□ 1.77
LRP3-201ENST00000253193 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.12■■□□□ 1.77
LRP3-201ENST00000253193 TRIM52Q96A61 297 aa26.12■■□□□ 1.77
LRP3-201ENST00000253193 ANP32CO43423 234 aa26.12■■□□□ 1.77
LRP3-201ENST00000253193 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.09■■□□□ 1.77
LRP3-201ENST00000253193 TONSLQ96HA7 1378 aa26.07■■□□□ 1.76
LRP3-201ENST00000253193 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.07■■□□□ 1.76
LRP3-201ENST00000253193 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.06■■□□□ 1.76
LRP3-201ENST00000253193 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.04■■□□□ 1.76
LRP3-201ENST00000253193 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.03■■□□□ 1.76
LRP3-201ENST00000253193 FKBP8Q14318 412 aa26.03■■□□□ 1.76
LRP3-201ENST00000253193 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
LRP3-201ENST00000253193 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.99■■□□□ 1.75
LRP3-201ENST00000253193 TIAM1Q13009 1591 aa25.93■■□□□ 1.74
LRP3-201ENST00000253193 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
LRP3-201ENST00000253193 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
LRP3-201ENST00000253193 NESP48681 1621 aa25.88■■□□□ 1.73
LRP3-201ENST00000253193 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.83■■□□□ 1.73
LRP3-201ENST00000253193 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.82■■□□□ 1.72
LRP3-201ENST00000253193 FMN1Q68DA7 1419 aa25.81■■□□□ 1.72
LRP3-201ENST00000253193 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.79■■□□□ 1.72
LRP3-201ENST00000253193 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
LRP3-201ENST00000253193 MAPKBP1O60336 1514 aa25.76■■□□□ 1.72
LRP3-201ENST00000253193 WDR97A6NE52 1622 aa25.76■■□□□ 1.71
LRP3-201ENST00000253193 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
LRP3-201ENST00000253193 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
LRP3-201ENST00000253193 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.73■■□□□ 1.71
LRP3-201ENST00000253193 TOPBP1Q92547 1522 aa25.73■■□□□ 1.71
LRP3-201ENST00000253193 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.73■■□□□ 1.71
LRP3-201ENST00000253193 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.71■■□□□ 1.71
LRP3-201ENST00000253193 FOXD1Q16676 465 aa25.7■■□□□ 1.7
LRP3-201ENST00000253193 MAP3K1Q13233 1512 aa25.69■■□□□ 1.7
LRP3-201ENST00000253193 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.69■■□□□ 1.7
LRP3-201ENST00000253193 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
LRP3-201ENST00000253193 FBLN2P98095 1184 aa25.68■■□□□ 1.7
LRP3-201ENST00000253193 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.67■■□□□ 1.7
LRP3-201ENST00000253193 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
LRP3-201ENST00000253193 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.66■■□□□ 1.7
LRP3-201ENST00000253193 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
LRP3-201ENST00000253193 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.63■■□□□ 1.69
LRP3-201ENST00000253193 CCER2I3L3R5 266 aa25.62■■□□□ 1.69
LRP3-201ENST00000253193 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
LRP3-201ENST00000253193 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.61■■□□□ 1.69
LRP3-201ENST00000253193 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.6■■□□□ 1.69
LRP3-201ENST00000253193 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.59■■□□□ 1.69
LRP3-201ENST00000253193 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
LRP3-201ENST00000253193 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.57■■□□□ 1.68
LRP3-201ENST00000253193 NCOA2Q15596 1464 aa25.55■■□□□ 1.68
LRP3-201ENST00000253193 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.54■■□□□ 1.68
LRP3-201ENST00000253193 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
LRP3-201ENST00000253193 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.53■■□□□ 1.68
LRP3-201ENST00000253193 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.52■■□□□ 1.68
LRP3-201ENST00000253193 UACAQ9BZF9 1416 aa25.52■■□□□ 1.68
LRP3-201ENST00000253193 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
LRP3-201ENST00000253193 PTPRKQ15262 1439 aa25.5■■□□□ 1.67
LRP3-201ENST00000253193 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
LRP3-201ENST00000253193 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.48■■□□□ 1.67
LRP3-201ENST00000253193 HFM1A2PYH4 1435 aa25.46■■□□□ 1.67
LRP3-201ENST00000253193 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
LRP3-201ENST00000253193 MRS2Q9HD23 443 aa25.46■■□□□ 1.67
LRP3-201ENST00000253193 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
LRP3-201ENST00000253193 NAIPQ13075 1403 aa25.44■■□□□ 1.66
LRP3-201ENST00000253193 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.663e-6■■■■□ 24.7
LRP3-201ENST00000253193 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.41■■□□□ 1.66
LRP3-201ENST00000253193 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.41■■□□□ 1.66
LRP3-201ENST00000253193 PRDM2Q13029 1718 aa25.41■■□□□ 1.66
LRP3-201ENST00000253193 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
LRP3-201ENST00000253193 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.38■■□□□ 1.65
LRP3-201ENST00000253193 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
LRP3-201ENST00000253193 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
LRP3-201ENST00000253193 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.36■■□□□ 1.65
LRP3-201ENST00000253193 CUL7Q14999 1698 aa25.36■■□□□ 1.65
LRP3-201ENST00000253193 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.33■■□□□ 1.65
LRP3-201ENST00000253193 BCL11AQ9H165 835 aa25.33■■□□□ 1.64
LRP3-201ENST00000253193 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.28■■□□□ 1.64
LRP3-201ENST00000253193 MSH5O43196 834 aa25.27■■□□□ 1.64
LRP3-201ENST00000253193 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.26■■□□□ 1.63
LRP3-201ENST00000253193 CCDC184Q52MB2 194 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP3-201ENST00000253193 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP3-201ENST00000253193 GRIN2BQ13224 1484 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP3-201ENST00000253193 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
LRP3-201ENST00000253193 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.22■■□□□ 1.63
LRP3-201ENST00000253193 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
LRP3-201ENST00000253193 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.21■■□□□ 1.63
LRP3-201ENST00000253193 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
LRP3-201ENST00000253193 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.19■■□□□ 1.62
LRP3-201ENST00000253193 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
LRP3-201ENST00000253193 PKD2Q13563 968 aa25.17■■□□□ 1.62
LRP3-201ENST00000253193 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
LRP3-201ENST00000253193 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.14■■□□□ 1.62
LRP3-201ENST00000253193 TSPY4P0CV99 314 aa25.14■■□□□ 1.62
LRP3-201ENST00000253193 TSPY10P0CW01 314 aa25.14■■□□□ 1.62
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