RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 IqubQ8CDK3 788 aa23,43■■□□□ 1,34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ClspnQ80YR7 1315 aa23,43■■□□□ 1,34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stk24Q99KH8 431 aa23,42■■□□□ 1,34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP23,41■■□□□ 1,34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kif15Q6P9L6 1387 aa23,41■■□□□ 1,34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP23,4■■□□□ 1,34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Aplp2Q06335 707 aa23,4■■□□□ 1,34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8BT18 775 aa23,38■■□□□ 1,33
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vsig10D3YX43 558 aa23,36■■□□□ 1,33
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP23,36■■□□□ 1,33
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa23,35■■□□□ 1,33
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP23,34■■□□□ 1,33
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP23,33■■□□□ 1,33
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ubap1lG3UW59 384 aa23,32■■□□□ 1,32
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ercc6F8VPZ5 1481 aa23,32■■□□□ 1,32
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm38655A0A286YDK6 273 aa23,32■■□□□ 1,32
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ecm2Q5FW85 670 aa23,29■■□□□ 1,32
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arid3cA6PWV5 409 aa23,28■■□□□ 1,32
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm20521D3Z5F7 333 aa23,27■■□□□ 1,32
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa23,27■■□□□ 1,32
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccer2J3QPU5 274 aa23,23■■□□□ 1,31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa23,22■■□□□ 1,31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stag3O70576 1240 aa23,21■■□□□ 1,31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Setd5Q5XJV7 1441 aa23,2■■□□□ 1,3
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP23,19■■□□□ 1,3
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cnga1P29974 684 aa23,17■■□□□ 1,3
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mrs2Q5NCE8 434 aa23,17■■□□□ 1,3
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CatipB9EKE5 520 aa23,15■■□□□ 1,3
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP23,15■■□□□ 1,3
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP23,14■■□□□ 1,29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Anp32aO35381 247 aa23,12■■□□□ 1,29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP23,08■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Apbb1Q9QXJ1 710 aa23,08■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppm1fQ8CGA0 452 aa23,07■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plin1Q8CGN5 517 aa23,07■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc18Q640L5 1455 aa23,06■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AknaQ80VW7 1404 aa23,06■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Neurod2Q62414 383 aa23,05■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sox12Q04890 314 aa23,04■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa23,04■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm6268A2A3U9 297 aa23,03■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stk26Q99JT2 416 aa23,02■■□□□ 1,28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myt1Q8CFC2 1127 aa23■■□□□ 1,27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cep164Q5DU05 1446 aa23■■□□□ 1,27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa22,96■■□□□ 1,27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rtl5Q5DTT4 599 aa22,96■■□□□ 1,27
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Psme1P97371 249 aa22,92■■□□□ 1,26
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Card11Q8CIS0 1159 aa22,92■■□□□ 1,26
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lmod3E9QA62 571 aa22,9■■□□□ 1,26
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22,89■■□□□ 1,25
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mtus2Q3UHD3 1353 aa22,87■■□□□ 1,25
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Txndc2Q6P902 515 aa22,87■■□□□ 1,25
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Calr4Q3TQS0 420 aa22,87■■□□□ 1,25
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sall2Q9QX96 1004 aa22,87■■□□□ 1,25
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf316Q6PGE4 1016 aa22,85■■□□□ 1,25
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NacadQ5SWP3 1504 aa22,84■■□□□ 1,25
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Armcx1Q9CX83 456 aa22,82■■□□□ 1,24
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim30dE9PWL0 497 aa22,81■■□□□ 1,24
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP22,81■■□□□ 1,24
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Iqcf3Q9D498 203 aa22,8■■□□□ 1,24
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tnnt1O88346 262 aa22,78■■□□□ 1,24
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP22,77■■□□□ 1,24
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bcl11bQ99PV8 884 aa22,77■■□□□ 1,24
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ciz1Q8VEH2 845 aa22,74■■□□□ 1,23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chrna2Q91X60 512 aa22,73■■□□□ 1,23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP22,73■■□□□ 1,23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP22,73■■□□□ 1,23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sh3bp5Q9Z131 463 aa22,71■■□□□ 1,23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PnnO35691 725 aaKnown RBP22,69■■□□□ 1,22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP22,68■■□□□ 1,22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Birc3O08863 600 aa22,67■■□□□ 1,22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ofd1Q80Z25 1017 aa22,67■■□□□ 1,22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lemd3Q9WU40 921 aa22,66■■□□□ 1,22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP22,64■■□□□ 1,22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HdgfP51859 237 aaKnown RBP22,64■■□□□ 1,22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eea1Q8BL66 1411 aa22,62■■□□□ 1,21
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pip4k2bQ80XI4 416 aa22,62■■□□□ 1,21
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pak3Q61036 559 aa22,61■■□□□ 1,21
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rpap1Q80TE0 1409 aa22,6■■□□□ 1,21
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP22,59■■□□□ 1,21
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rassf8Q8CJ96 419 aa22,58■■□□□ 1,21
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP22,58■■□□□ 1,2
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dbr1Q923B1 550 aa22,58■■□□□ 1,2
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP22,56■■□□□ 1,2
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Map4P27546 1125 aaKnown RBP22,56■■□□□ 1,2
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa22,56■■□□□ 1,2
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PtmaP26350 111 aa22,52■■□□□ 1,2
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kif27Q7M6Z4 1394 aa22,52■■□□□ 1,2
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CanxP35564 591 aaKnown RBP22,49■■□□□ 1,19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NudcO35685 332 aaKnown RBP22,49■■□□□ 1,19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kif3bQ61771 747 aa22,49■■□□□ 1,19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Anapc15P60007 132 aa22,48■■□□□ 1,19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp777B9EKF4 885 aa22,48■■□□□ 1,19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Golga3P55937 1487 aa22,47■■□□□ 1,19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q3TQI7 289 aaKnown RBP22,47■■□□□ 1,19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pibf1E9Q6K3 756 aa22,47■■□□□ 1,19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa22,45■■□□□ 1,18
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plcb2A3KGF7 1181 aa22,45■■□□□ 1,18
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chmp3Q9CQ10 224 aa22,42■■□□□ 1,18
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP22,4■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,7 ms