RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rhox8Q6VSS7 320 aa31.78■■■□□ 2.68
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cngb1E1AZ71 1325 aa28.2■■■□□ 2.1
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ube2uB1AUC4 352 aa28.18■■■□□ 2.1
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa28.16■■■□□ 2.1
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zeb1Q64318 1117 aa28.14■■■□□ 2.09
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc24a1Q91WD8 1130 aa26.37■■□□□ 1.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NischQ80TM9 1593 aa26.3■■□□□ 1.8
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Abcc9P70170 1546 aa26.01■■□□□ 1.75
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa26.01■■□□□ 1.75
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plppr3Q7TPB0 716 aa25.92■■□□□ 1.74
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa25.87■■□□□ 1.73
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 HrcG5E8J6 738 aa25.76■■□□□ 1.71
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm13697A2AK42 830 aa25.73■■□□□ 1.71
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp1b4Q99ME6 356 aa25.34■■□□□ 1.65
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stra8P70278 393 aa25.3■■□□□ 1.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa25.3■■□□□ 1.64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NrdcQ8BHG1 1161 aa25.25■■□□□ 1.63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zbtb4Q5F293 982 aa25.23■■□□□ 1.63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lmod2Q3UHZ5 550 aa25.21■■□□□ 1.63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Erich6D3Z6S9 713 aa25.2■■□□□ 1.63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NefmP08553 848 aa25.2■■□□□ 1.63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm13695A2AK44 830 aa25.18■■□□□ 1.62
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa25.14■■□□□ 1.61
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NeflP08551 543 aa24.98■■□□□ 1.59
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CenpbP27790 599 aa24.86■■□□□ 1.57
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa24.74■■□□□ 1.55
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Polr3glQ8R0C0 218 aa24.62■■□□□ 1.53
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.61■■□□□ 1.53
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ubl4bQ9CQ84 188 aa24.6■■□□□ 1.53
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nlrp6Q91WS2 869 aa24.58■■□□□ 1.53
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TonslQ6NZL6 1363 aa24.52■■□□□ 1.52
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa24.48■■□□□ 1.51
Ptprf-201ENSMUST00000049074 P3h3Q8CG70 732 aa24.41■■□□□ 1.5
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa24.37■■□□□ 1.49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rtl1Q7M732 1744 aa24.24■■□□□ 1.47
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mier1Q5UAK0 511 aa24.23■■□□□ 1.47
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MyclP10166 368 aa24.2■■□□□ 1.46
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ArxO35085 564 aa24.19■■□□□ 1.46
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eid3Q3V124 375 aa24.17■■□□□ 1.46
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tnnt3Q9QZ47 272 aa24.1■■□□□ 1.45
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Irx6Q9ER75 438 aa24.07■■□□□ 1.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chic2Q9D9G3 165 aa24.07■■□□□ 1.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa23.97■■□□□ 1.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Csrnp3P59055 597 aa23.9■■□□□ 1.42
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pcgf6Q99NA9 353 aa23.86■■□□□ 1.41
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Clip1Q922J3 1391 aa23.84■■□□□ 1.41
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NgefQ8CHT1 710 aa23.8■■□□□ 1.4
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim26Q99PN3 545 aa23.74■■□□□ 1.39
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa23.67■■□□□ 1.38
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 DaxxO35613 739 aa23.6■■□□□ 1.37
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kdm2aP59997 1161 aa23.6■■□□□ 1.37
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fgd1P52734 960 aa23.59■■□□□ 1.37
Ptprf-201ENSMUST00000049074 BlmO88700 1416 aa23.55■■□□□ 1.36
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf326O88291 580 aa23.53■■□□□ 1.36
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Clstn2Q9ER65 966 aa23.52■■□□□ 1.36
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rgl3Q3UYI5 709 aa23.49■■□□□ 1.35
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Clstn1Q9EPL2 979 aa23.48■■□□□ 1.35
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Abcc8B2RUS7 1588 aa23.45■■□□□ 1.34
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