RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rhox8Q6VSS7 320 aa31,78■■■□□ 2,68
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP28,42■■■□□ 2,14
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP28,33■■■□□ 2,13
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cngb1E1AZ71 1325 aa28,2■■■□□ 2,1
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ube2uB1AUC4 352 aa28,18■■■□□ 2,1
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa28,16■■■□□ 2,1
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zeb1Q64318 1117 aa28,14■■■□□ 2,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Npm2Q80W85 207 aa27,68■■■□□ 2,02
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gab3Q8BSM5 595 aa27,67■■■□□ 2,02
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myt1lP97500 1187 aa27,47■■□□□ 1,99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wdr66E9Q743 1299 aa27,41■■□□□ 1,98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP27,12■■□□□ 1,93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim41Q5NCC3 630 aa26,96■■□□□ 1,91
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Il27Q8K3I6 234 aa26,84■■□□□ 1,89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa26,56■■□□□ 1,84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 UbtfP25976 765 aaKnown RBP26,41■■□□□ 1,82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc24a1Q91WD8 1130 aa26,37■■□□□ 1,81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NischQ80TM9 1593 aa26,3■■□□□ 1,8
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP26,3■■□□□ 1,8
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa26,18■■□□□ 1,78
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa26,09■■□□□ 1,77
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Os9Q8K2C7 672 aa26,08■■□□□ 1,76
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Neurod1Q60867 357 aa26,01■■□□□ 1,75
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Abcc9P70170 1546 aa26,01■■□□□ 1,75
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa26,01■■□□□ 1,75
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plppr3Q7TPB0 716 aa25,92■■□□□ 1,74
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa25,87■■□□□ 1,73
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP25,86■■□□□ 1,73
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HrcG5E8J6 738 aa25,76■■□□□ 1,71
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm13697A2AK42 830 aa25,73■■□□□ 1,71
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chic1Q8CBW7 227 aa25,61■■□□□ 1,69
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Amer1Q7TS75 1132 aa25,59■■□□□ 1,69
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP25,54■■□□□ 1,68
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP25,47■■□□□ 1,67
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa25,41■■□□□ 1,66
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP25,36■■□□□ 1,65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp1b4Q99ME6 356 aa25,34■■□□□ 1,65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NclP09405 707 aaKnown RBP25,33■■□□□ 1,65
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stra8P70278 393 aa25,3■■□□□ 1,64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP25,3■■□□□ 1,64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa25,3■■□□□ 1,64
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP25,26■■□□□ 1,63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP25,26■■□□□ 1,63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NrdcQ8BHG1 1161 aa25,25■■□□□ 1,63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zbtb4Q5F293 982 aa25,23■■□□□ 1,63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lmod2Q3UHZ5 550 aa25,21■■□□□ 1,63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Erich6D3Z6S9 713 aa25,2■■□□□ 1,63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NefmP08553 848 aa25,2■■□□□ 1,63
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm13695A2AK44 830 aa25,18■■□□□ 1,62
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa25,14■■□□□ 1,61
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NeflP08551 543 aa24,98■■□□□ 1,59
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CenpbP27790 599 aa24,86■■□□□ 1,57
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP24,79■■□□□ 1,56
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa24,74■■□□□ 1,55
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP24,73■■□□□ 1,55
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4933416C03RikQ3V063 378 aa24,66■■□□□ 1,54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP24,66■■□□□ 1,54
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP24,64■■□□□ 1,53
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Polr3glQ8R0C0 218 aa24,62■■□□□ 1,53
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24,61■■□□□ 1,53
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ubl4bQ9CQ84 188 aa24,6■■□□□ 1,53
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nlrp6Q91WS2 869 aa24,58■■□□□ 1,53
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TonslQ6NZL6 1363 aa24,52■■□□□ 1,52
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP24,51■■□□□ 1,51
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa24,48■■□□□ 1,51
Ptprf-201ENSMUST00000049074 P3h3Q8CG70 732 aa24,41■■□□□ 1,5
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP24,38■■□□□ 1,49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa24,37■■□□□ 1,49
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rtl1Q7M732 1744 aa24,24■■□□□ 1,47
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mier1Q5UAK0 511 aa24,23■■□□□ 1,47
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MyclP10166 368 aa24,2■■□□□ 1,46
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ArxO35085 564 aa24,19■■□□□ 1,46
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eid3Q3V124 375 aa24,17■■□□□ 1,46
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tnnt3Q9QZ47 272 aa24,1■■□□□ 1,45
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Irx6Q9ER75 438 aa24,07■■□□□ 1,44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chic2Q9D9G3 165 aa24,07■■□□□ 1,44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa23,97■■□□□ 1,43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Csrnp3P59055 597 aa23,9■■□□□ 1,42
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pcgf6Q99NA9 353 aa23,86■■□□□ 1,41
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Clip1Q922J3 1391 aa23,84■■□□□ 1,41
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP23,84■■□□□ 1,41
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NgefQ8CHT1 710 aa23,8■■□□□ 1,4
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP23,79■■□□□ 1,4
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim26Q99PN3 545 aa23,74■■□□□ 1,39
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP23,71■■□□□ 1,39
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arhgap27A2AB59 869 aa23,7■■□□□ 1,38
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP23,67■■□□□ 1,38
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa23,67■■□□□ 1,38
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP23,66■■□□□ 1,38
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ggt6Q6PDE7 497 aa23,62■■□□□ 1,37
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DaxxO35613 739 aa23,6■■□□□ 1,37
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kdm2aP59997 1161 aa23,6■■□□□ 1,37
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fgd1P52734 960 aa23,59■■□□□ 1,37
Ptprf-201ENSMUST00000049074 BlmO88700 1416 aa23,55■■□□□ 1,36
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP23,53■■□□□ 1,36
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf326O88291 580 aa23,53■■□□□ 1,36
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Clstn2Q9ER65 966 aa23,52■■□□□ 1,36
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rgl3Q3UYI5 709 aa23,49■■□□□ 1,35
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Clstn1Q9EPL2 979 aa23,48■■□□□ 1,35
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Abcc8B2RUS7 1588 aa23,45■■□□□ 1,34
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