RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fabp6P51162 128 aa23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr133Q8VG94 312 aa23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Elovl6Q920L5 267 aa23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hdhd3Q9CYW4 251 aa23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cxcr6Q9EQ16 351 aa23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 LhbO09108 141 aa23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm12790B1AUV6 201 aa23.52■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 BC030500E9Q6W0 185 aa23.52■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 RprmlQ3URD2 117 aa23.52■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gpr87Q99MT7 358 aa23.52■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pard6aQ9Z101 346 aa23.52■■□□□ 1.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm2026A2ART4 498 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r14H3BJ46 303 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm648Q3UJ22 213 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pea15Q62048 130 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr205Q7TS37 305 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dcun1d4Q8CCA0 292 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr368Q8VF22 327 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rbmxl2Q9DAE2 385 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Esp23A8R0V5 104 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AmbpQ07456 349 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ifna14Q810G3 189 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r229Q8R2A9 306 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr512Q8VFZ4 326 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Elovl1Q9JLJ5 279 aa23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1189A2AV11 306 aa23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem71Q149F5 287 aa23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sdr39u1Q5M8N4 308 aa23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnf183Q8QZS5 190 aa23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp6v0bQ91V37 205 aa23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mus81Q91ZJ0 551 aa23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ifitm7G3X9Z2 141 aa23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Txn2P97493 166 aa23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znrf2Q71FD5 238 aa23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slamf7Q8BHK6 333 aa23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem160Q9D938 188 aa23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Orc6Q9WUJ8 262 aa23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm12728V9GX31 77 aa23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r232A2RTT5 351 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ly6g6fB2RXM6 300 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Amn1B8JKV0 258 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr204E9Q8M0 305 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P18528 98 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp273Q7M6W8 501 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Il22ra2Q80XF5 230 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1155Q8VFR3 314 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mesp2O08574 370 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bri3P28662 125 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nhlrc1Q8BR37 401 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Xrcc3Q9CXE6 349 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnase4Q9JJH1 148 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm5458L7N219 204 aa23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rpl12P35979 165 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Psg25Q497W1 475 aa23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rasl11aQ6IMB1 242 aa23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ms4a6cQ99N08 217 aa23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 UrahQ9CRB3 118 aa23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clec6aQ9JKF4 209 aa23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Psmb3Q9R1P1 205 aa23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dmrtb1A2A9I7 359 aa23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tcte2E9PY37 120 aa23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm9Q3UKW5 162 aa23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lhfpl1Q80SV1 220 aa23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr916Q8VG53 310 aa23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr206Q8VGP9 306 aa23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv8-9A0A0G2JET1 119 aa23.45■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv1-77A0A0G2JGS9 117 aa23.45■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 IfngP01580 155 aa23.45■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1293-psA0A1L1SVB5 326 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21915J3QPM7 133 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ucp1P12242 307 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf474Q6V5K9 347 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc37a1Q8R070 531 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nicn1Q9CQM0 213 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Akirin2B1AXD8 201 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Esp8F7AMQ8 149 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gpa33Q9JKA5 319 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnd2Q9QYM5 227 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DeddQ9Z1L3 318 aa23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P01748 117 aa23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Npy1rQ04573 382 aa23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 H2-M10.6Q85ZW5 330 aa23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hint2Q9D0S9 163 aa23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 RprmQ9JJ72 109 aa23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r194J3JS27 296 aa23.42■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tcrg-V1P06325 135 aa23.42■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PmchP56942 165 aa23.42■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Habp2Q8K0D2 558 aa23.42■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc45a2P58355 530 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zc4h2Q68FG0 224 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr433Q7TRV9 314 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 COA4Q8BT51 87 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr638Q8VH20 321 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnf141Q99MB7 230 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arl3Q9WUL7 182 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv5-16A0A0B4J1P4 117 aa23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 69.4 ms