Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Psmb3Q9R1P1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Psmb3Q9R1P1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psmb3Q9R1P1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psmb3Q9R1P1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Psmb3Q9R1P1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Psmb3Q9R1P1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmb3Q9R1P1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmb3Q9R1P1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmb3Q9R1P1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmb3Q9R1P1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmb3Q9R1P1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmb3Q9R1P1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmb3Q9R1P1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmb3Q9R1P1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmb3Q9R1P1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psmb3Q9R1P1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmb3Q9R1P1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psmb3Q9R1P1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmb3Q9R1P1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmb3Q9R1P1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmb3Q9R1P1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmb3Q9R1P1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmb3Q9R1P1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmb3Q9R1P1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmb3Q9R1P1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmb3Q9R1P1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmb3Q9R1P1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmb3Q9R1P1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psmb3Q9R1P1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmb3Q9R1P1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmb3Q9R1P1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmb3Q9R1P1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmb3Q9R1P1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmb3Q9R1P1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmb3Q9R1P1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmb3Q9R1P1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmb3Q9R1P1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmb3Q9R1P1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmb3Q9R1P1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmb3Q9R1P1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Psmb3Q9R1P1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmb3Q9R1P1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmb3Q9R1P1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmb3Q9R1P1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmb3Q9R1P1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmb3Q9R1P1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmb3Q9R1P1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmb3Q9R1P1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmb3Q9R1P1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmb3Q9R1P1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmb3Q9R1P1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmb3Q9R1P1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmb3Q9R1P1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmb3Q9R1P1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmb3Q9R1P1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmb3Q9R1P1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmb3Q9R1P1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmb3Q9R1P1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmb3Q9R1P1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmb3Q9R1P1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmb3Q9R1P1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmb3Q9R1P1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmb3Q9R1P1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmb3Q9R1P1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmb3Q9R1P1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmb3Q9R1P1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmb3Q9R1P1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmb3Q9R1P1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmb3Q9R1P1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmb3Q9R1P1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmb3Q9R1P1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmb3Q9R1P1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmb3Q9R1P1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psmb3Q9R1P1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmb3Q9R1P1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb3Q9R1P1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmb3Q9R1P1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmb3Q9R1P1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmb3Q9R1P1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb3Q9R1P1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmb3Q9R1P1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb3Q9R1P1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb3Q9R1P1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb3Q9R1P1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb3Q9R1P1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmb3Q9R1P1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb3Q9R1P1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb3Q9R1P1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmb3Q9R1P1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmb3Q9R1P1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmb3Q9R1P1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmb3Q9R1P1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmb3Q9R1P1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmb3Q9R1P1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmb3Q9R1P1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmb3Q9R1P1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms