Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Psmb3Q9R1P1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Psmb3Q9R1P1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Psmb3Q9R1P1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Psmb3Q9R1P1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Psmb3Q9R1P1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Psmb3Q9R1P1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Psmb3Q9R1P1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Psmb3Q9R1P1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Psmb3Q9R1P1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Psmb3Q9R1P1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Psmb3Q9R1P1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Psmb3Q9R1P1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Psmb3Q9R1P1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Psmb3Q9R1P1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Psmb3Q9R1P1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Psmb3Q9R1P1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Psmb3Q9R1P1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Psmb3Q9R1P1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Psmb3Q9R1P1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,69■■□□□ 1,54
Psmb3Q9R1P1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Psmb3Q9R1P1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Psmb3Q9R1P1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Psmb3Q9R1P1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Psmb3Q9R1P1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Psmb3Q9R1P1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Psmb3Q9R1P1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
Psmb3Q9R1P1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Psmb3Q9R1P1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
Psmb3Q9R1P1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Psmb3Q9R1P1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Psmb3Q9R1P1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Psmb3Q9R1P1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Psmb3Q9R1P1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Psmb3Q9R1P1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Psmb3Q9R1P1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,89■■□□□ 1,42
Psmb3Q9R1P1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Psmb3Q9R1P1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
Psmb3Q9R1P1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Psmb3Q9R1P1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Psmb3Q9R1P1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,83■■□□□ 1,4
Psmb3Q9R1P1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Psmb3Q9R1P1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Psmb3Q9R1P1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Psmb3Q9R1P1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Psmb3Q9R1P1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Psmb3Q9R1P1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Psmb3Q9R1P1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Psmb3Q9R1P1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,72■■□□□ 1,39
Psmb3Q9R1P1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Psmb3Q9R1P1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Psmb3Q9R1P1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Psmb3Q9R1P1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Psmb3Q9R1P1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Psmb3Q9R1P1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Psmb3Q9R1P1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Psmb3Q9R1P1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Psmb3Q9R1P1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Psmb3Q9R1P1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Psmb3Q9R1P1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Psmb3Q9R1P1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Psmb3Q9R1P1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Psmb3Q9R1P1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Psmb3Q9R1P1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Psmb3Q9R1P1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Psmb3Q9R1P1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Psmb3Q9R1P1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Psmb3Q9R1P1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,07■■□□□ 1,28
Psmb3Q9R1P1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Psmb3Q9R1P1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Psmb3Q9R1P1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Psmb3Q9R1P1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Psmb3Q9R1P1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Psmb3Q9R1P1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23■■□□□ 1,27
Psmb3Q9R1P1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Psmb3Q9R1P1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Psmb3Q9R1P1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Psmb3Q9R1P1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Psmb3Q9R1P1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Psmb3Q9R1P1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Psmb3Q9R1P1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Psmb3Q9R1P1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Psmb3Q9R1P1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,71■■□□□ 1,23
Psmb3Q9R1P1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Psmb3Q9R1P1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Psmb3Q9R1P1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Psmb3Q9R1P1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Psmb3Q9R1P1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Psmb3Q9R1P1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Psmb3Q9R1P1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Psmb3Q9R1P1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Psmb3Q9R1P1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Psmb3Q9R1P1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Psmb3Q9R1P1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Psmb3Q9R1P1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Psmb3Q9R1P1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Psmb3Q9R1P1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms