Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG0

Zc4h2, Zinc finger C4H2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc4h2Q68FG0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zc4h2Q68FG0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc4h2Q68FG0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zc4h2Q68FG0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Zc4h2Q68FG0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zc4h2Q68FG0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zc4h2Q68FG0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zc4h2Q68FG0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Zc4h2Q68FG0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zc4h2Q68FG0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zc4h2Q68FG0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zc4h2Q68FG0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zc4h2Q68FG0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zc4h2Q68FG0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zc4h2Q68FG0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zc4h2Q68FG0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zc4h2Q68FG0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc4h2Q68FG0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc4h2Q68FG0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc4h2Q68FG0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zc4h2Q68FG0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zc4h2Q68FG0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zc4h2Q68FG0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zc4h2Q68FG0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zc4h2Q68FG0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zc4h2Q68FG0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zc4h2Q68FG0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zc4h2Q68FG0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zc4h2Q68FG0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zc4h2Q68FG0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zc4h2Q68FG0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zc4h2Q68FG0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zc4h2Q68FG0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zc4h2Q68FG0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc4h2Q68FG0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc4h2Q68FG0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zc4h2Q68FG0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zc4h2Q68FG0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zc4h2Q68FG0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zc4h2Q68FG0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc4h2Q68FG0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc4h2Q68FG0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc4h2Q68FG0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc4h2Q68FG0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc4h2Q68FG0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc4h2Q68FG0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc4h2Q68FG0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc4h2Q68FG0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc4h2Q68FG0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc4h2Q68FG0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc4h2Q68FG0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc4h2Q68FG0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc4h2Q68FG0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc4h2Q68FG0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc4h2Q68FG0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc4h2Q68FG0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc4h2Q68FG0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc4h2Q68FG0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc4h2Q68FG0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc4h2Q68FG0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc4h2Q68FG0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc4h2Q68FG0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc4h2Q68FG0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc4h2Q68FG0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc4h2Q68FG0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc4h2Q68FG0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc4h2Q68FG0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc4h2Q68FG0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc4h2Q68FG0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc4h2Q68FG0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc4h2Q68FG0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc4h2Q68FG0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zc4h2Q68FG0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Zc4h2Q68FG0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc4h2Q68FG0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc4h2Q68FG0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zc4h2Q68FG0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zc4h2Q68FG0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc4h2Q68FG0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zc4h2Q68FG0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc4h2Q68FG0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc4h2Q68FG0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc4h2Q68FG0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc4h2Q68FG0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc4h2Q68FG0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc4h2Q68FG0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zc4h2Q68FG0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc4h2Q68FG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc4h2Q68FG0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc4h2Q68FG0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc4h2Q68FG0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc4h2Q68FG0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc4h2Q68FG0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc4h2Q68FG0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc4h2Q68FG0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc4h2Q68FG0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc4h2Q68FG0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc4h2Q68FG0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc4h2Q68FG0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc4h2Q68FG0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms