Protein–RNA interactions for Protein: Q149F5

Tmem71, Transmembrane protein 71, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem71Q149F5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmem71Q149F5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmem71Q149F5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem71Q149F5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem71Q149F5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem71Q149F5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmem71Q149F5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem71Q149F5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem71Q149F5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmem71Q149F5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem71Q149F5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem71Q149F5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem71Q149F5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem71Q149F5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem71Q149F5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem71Q149F5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem71Q149F5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmem71Q149F5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem71Q149F5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem71Q149F5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem71Q149F5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem71Q149F5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem71Q149F5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem71Q149F5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem71Q149F5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem71Q149F5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem71Q149F5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem71Q149F5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem71Q149F5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem71Q149F5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem71Q149F5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem71Q149F5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem71Q149F5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem71Q149F5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem71Q149F5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem71Q149F5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem71Q149F5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem71Q149F5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem71Q149F5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem71Q149F5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem71Q149F5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem71Q149F5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem71Q149F5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem71Q149F5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem71Q149F5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem71Q149F5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem71Q149F5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem71Q149F5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem71Q149F5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem71Q149F5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem71Q149F5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem71Q149F5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem71Q149F5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem71Q149F5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem71Q149F5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem71Q149F5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem71Q149F5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem71Q149F5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem71Q149F5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem71Q149F5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem71Q149F5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem71Q149F5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem71Q149F5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem71Q149F5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem71Q149F5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tmem71Q149F5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem71Q149F5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem71Q149F5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem71Q149F5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem71Q149F5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem71Q149F5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem71Q149F5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem71Q149F5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem71Q149F5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem71Q149F5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem71Q149F5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem71Q149F5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem71Q149F5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem71Q149F5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem71Q149F5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem71Q149F5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem71Q149F5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem71Q149F5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem71Q149F5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem71Q149F5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem71Q149F5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem71Q149F5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem71Q149F5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem71Q149F5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem71Q149F5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem71Q149F5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem71Q149F5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem71Q149F5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem71Q149F5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem71Q149F5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem71Q149F5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem71Q149F5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem71Q149F5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem71Q149F5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem71Q149F5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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