Protein–RNA interactions for Protein: Q04573

Npy1r, Neuropeptide Y receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npy1rQ04573 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npy1rQ04573 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Npy1rQ04573 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npy1rQ04573 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npy1rQ04573 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Npy1rQ04573 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npy1rQ04573 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npy1rQ04573 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npy1rQ04573 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npy1rQ04573 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Npy1rQ04573 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npy1rQ04573 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npy1rQ04573 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npy1rQ04573 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npy1rQ04573 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Npy1rQ04573 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Npy1rQ04573 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npy1rQ04573 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npy1rQ04573 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npy1rQ04573 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npy1rQ04573 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npy1rQ04573 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npy1rQ04573 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npy1rQ04573 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npy1rQ04573 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npy1rQ04573 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npy1rQ04573 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Npy1rQ04573 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npy1rQ04573 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Npy1rQ04573 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Npy1rQ04573 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Npy1rQ04573 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Npy1rQ04573 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Npy1rQ04573 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Npy1rQ04573 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Npy1rQ04573 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Npy1rQ04573 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npy1rQ04573 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npy1rQ04573 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npy1rQ04573 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Npy1rQ04573 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npy1rQ04573 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npy1rQ04573 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npy1rQ04573 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npy1rQ04573 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npy1rQ04573 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npy1rQ04573 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npy1rQ04573 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Npy1rQ04573 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npy1rQ04573 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npy1rQ04573 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npy1rQ04573 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npy1rQ04573 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npy1rQ04573 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Npy1rQ04573 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Npy1rQ04573 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npy1rQ04573 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npy1rQ04573 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npy1rQ04573 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Npy1rQ04573 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npy1rQ04573 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npy1rQ04573 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npy1rQ04573 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Npy1rQ04573 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npy1rQ04573 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npy1rQ04573 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Npy1rQ04573 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Npy1rQ04573 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npy1rQ04573 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npy1rQ04573 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npy1rQ04573 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npy1rQ04573 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npy1rQ04573 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npy1rQ04573 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npy1rQ04573 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npy1rQ04573 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npy1rQ04573 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npy1rQ04573 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Npy1rQ04573 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npy1rQ04573 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npy1rQ04573 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npy1rQ04573 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npy1rQ04573 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npy1rQ04573 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npy1rQ04573 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npy1rQ04573 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npy1rQ04573 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npy1rQ04573 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npy1rQ04573 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npy1rQ04573 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npy1rQ04573 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npy1rQ04573 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npy1rQ04573 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npy1rQ04573 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npy1rQ04573 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npy1rQ04573 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npy1rQ04573 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npy1rQ04573 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npy1rQ04573 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npy1rQ04573 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms