Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Vmn1r232A2RTT5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vmn1r232A2RTT5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r232A2RTT5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn1r232A2RTT5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn1r232A2RTT5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn1r232A2RTT5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vmn1r232A2RTT5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r232A2RTT5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r232A2RTT5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r232A2RTT5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r232A2RTT5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r232A2RTT5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r232A2RTT5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r232A2RTT5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r232A2RTT5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r232A2RTT5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r232A2RTT5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r232A2RTT5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r232A2RTT5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r232A2RTT5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r232A2RTT5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r232A2RTT5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r232A2RTT5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r232A2RTT5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r232A2RTT5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r232A2RTT5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r232A2RTT5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r232A2RTT5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r232A2RTT5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r232A2RTT5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r232A2RTT5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r232A2RTT5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r232A2RTT5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r232A2RTT5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r232A2RTT5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r232A2RTT5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r232A2RTT5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r232A2RTT5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r232A2RTT5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r232A2RTT5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r232A2RTT5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r232A2RTT5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r232A2RTT5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r232A2RTT5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r232A2RTT5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r232A2RTT5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r232A2RTT5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r232A2RTT5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r232A2RTT5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r232A2RTT5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r232A2RTT5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r232A2RTT5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r232A2RTT5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r232A2RTT5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r232A2RTT5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r232A2RTT5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r232A2RTT5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r232A2RTT5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r232A2RTT5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r232A2RTT5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r232A2RTT5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r232A2RTT5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r232A2RTT5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r232A2RTT5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r232A2RTT5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r232A2RTT5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r232A2RTT5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r232A2RTT5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r232A2RTT5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r232A2RTT5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r232A2RTT5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r232A2RTT5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r232A2RTT5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r232A2RTT5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r232A2RTT5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r232A2RTT5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r232A2RTT5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r232A2RTT5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r232A2RTT5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r232A2RTT5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r232A2RTT5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r232A2RTT5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r232A2RTT5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r232A2RTT5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r232A2RTT5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r232A2RTT5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r232A2RTT5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r232A2RTT5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r232A2RTT5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r232A2RTT5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r232A2RTT5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r232A2RTT5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r232A2RTT5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r232A2RTT5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r232A2RTT5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms