Protein–RNA interactions for Protein: Q80SV1

Lhfpl1, LHFPL tetraspan subfamily member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl1Q80SV1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lhfpl1Q80SV1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lhfpl1Q80SV1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lhfpl1Q80SV1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lhfpl1Q80SV1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lhfpl1Q80SV1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lhfpl1Q80SV1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lhfpl1Q80SV1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lhfpl1Q80SV1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lhfpl1Q80SV1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lhfpl1Q80SV1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lhfpl1Q80SV1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lhfpl1Q80SV1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lhfpl1Q80SV1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lhfpl1Q80SV1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lhfpl1Q80SV1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lhfpl1Q80SV1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lhfpl1Q80SV1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhfpl1Q80SV1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lhfpl1Q80SV1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhfpl1Q80SV1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lhfpl1Q80SV1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lhfpl1Q80SV1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lhfpl1Q80SV1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhfpl1Q80SV1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhfpl1Q80SV1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lhfpl1Q80SV1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lhfpl1Q80SV1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lhfpl1Q80SV1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lhfpl1Q80SV1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhfpl1Q80SV1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhfpl1Q80SV1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhfpl1Q80SV1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lhfpl1Q80SV1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lhfpl1Q80SV1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lhfpl1Q80SV1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lhfpl1Q80SV1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lhfpl1Q80SV1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lhfpl1Q80SV1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lhfpl1Q80SV1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lhfpl1Q80SV1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lhfpl1Q80SV1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lhfpl1Q80SV1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lhfpl1Q80SV1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lhfpl1Q80SV1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lhfpl1Q80SV1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lhfpl1Q80SV1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lhfpl1Q80SV1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lhfpl1Q80SV1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lhfpl1Q80SV1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lhfpl1Q80SV1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhfpl1Q80SV1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lhfpl1Q80SV1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhfpl1Q80SV1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhfpl1Q80SV1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lhfpl1Q80SV1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhfpl1Q80SV1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhfpl1Q80SV1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhfpl1Q80SV1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhfpl1Q80SV1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhfpl1Q80SV1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhfpl1Q80SV1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhfpl1Q80SV1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhfpl1Q80SV1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhfpl1Q80SV1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lhfpl1Q80SV1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhfpl1Q80SV1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhfpl1Q80SV1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhfpl1Q80SV1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhfpl1Q80SV1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhfpl1Q80SV1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhfpl1Q80SV1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lhfpl1Q80SV1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lhfpl1Q80SV1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhfpl1Q80SV1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhfpl1Q80SV1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhfpl1Q80SV1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhfpl1Q80SV1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhfpl1Q80SV1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lhfpl1Q80SV1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhfpl1Q80SV1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhfpl1Q80SV1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhfpl1Q80SV1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhfpl1Q80SV1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lhfpl1Q80SV1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lhfpl1Q80SV1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhfpl1Q80SV1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhfpl1Q80SV1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhfpl1Q80SV1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhfpl1Q80SV1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhfpl1Q80SV1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhfpl1Q80SV1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhfpl1Q80SV1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhfpl1Q80SV1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhfpl1Q80SV1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhfpl1Q80SV1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhfpl1Q80SV1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lhfpl1Q80SV1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lhfpl1Q80SV1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lhfpl1Q80SV1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms