Protein–RNA interactions for Protein: B1AXD8

Akirin2, Akirin-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akirin2B1AXD8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Akirin2B1AXD8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Akirin2B1AXD8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Akirin2B1AXD8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Akirin2B1AXD8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Akirin2B1AXD8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Akirin2B1AXD8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Akirin2B1AXD8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Akirin2B1AXD8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Akirin2B1AXD8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Akirin2B1AXD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Akirin2B1AXD8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Akirin2B1AXD8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Akirin2B1AXD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Akirin2B1AXD8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Akirin2B1AXD8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akirin2B1AXD8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akirin2B1AXD8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akirin2B1AXD8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Akirin2B1AXD8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Akirin2B1AXD8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Akirin2B1AXD8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Akirin2B1AXD8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Akirin2B1AXD8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akirin2B1AXD8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akirin2B1AXD8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Akirin2B1AXD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akirin2B1AXD8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Akirin2B1AXD8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akirin2B1AXD8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akirin2B1AXD8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Akirin2B1AXD8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akirin2B1AXD8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Akirin2B1AXD8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Akirin2B1AXD8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Akirin2B1AXD8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Akirin2B1AXD8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Akirin2B1AXD8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Akirin2B1AXD8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Akirin2B1AXD8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Akirin2B1AXD8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Akirin2B1AXD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Akirin2B1AXD8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Akirin2B1AXD8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Akirin2B1AXD8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Akirin2B1AXD8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Akirin2B1AXD8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Akirin2B1AXD8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Akirin2B1AXD8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Akirin2B1AXD8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Akirin2B1AXD8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Akirin2B1AXD8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Akirin2B1AXD8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Akirin2B1AXD8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Akirin2B1AXD8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Akirin2B1AXD8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Akirin2B1AXD8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Akirin2B1AXD8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Akirin2B1AXD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Akirin2B1AXD8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Akirin2B1AXD8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Akirin2B1AXD8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Akirin2B1AXD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Akirin2B1AXD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Akirin2B1AXD8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Akirin2B1AXD8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Akirin2B1AXD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Akirin2B1AXD8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Akirin2B1AXD8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Akirin2B1AXD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Akirin2B1AXD8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Akirin2B1AXD8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Akirin2B1AXD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Akirin2B1AXD8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Akirin2B1AXD8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akirin2B1AXD8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akirin2B1AXD8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akirin2B1AXD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akirin2B1AXD8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Akirin2B1AXD8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Akirin2B1AXD8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Akirin2B1AXD8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Akirin2B1AXD8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Akirin2B1AXD8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Akirin2B1AXD8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Akirin2B1AXD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Akirin2B1AXD8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Akirin2B1AXD8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Akirin2B1AXD8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akirin2B1AXD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Akirin2B1AXD8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Akirin2B1AXD8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Akirin2B1AXD8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Akirin2B1AXD8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Akirin2B1AXD8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Akirin2B1AXD8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Akirin2B1AXD8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Akirin2B1AXD8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akirin2B1AXD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Akirin2B1AXD8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms