Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Tcrg-V1P06325 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Tcrg-V1P06325 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tcrg-V1P06325 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Tcrg-V1P06325 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Tcrg-V1P06325 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Tcrg-V1P06325 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Tcrg-V1P06325 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tcrg-V1P06325 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tcrg-V1P06325 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Tcrg-V1P06325 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tcrg-V1P06325 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Tcrg-V1P06325 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Tcrg-V1P06325 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Tcrg-V1P06325 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tcrg-V1P06325 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tcrg-V1P06325 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tcrg-V1P06325 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tcrg-V1P06325 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Tcrg-V1P06325 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Tcrg-V1P06325 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Tcrg-V1P06325 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Tcrg-V1P06325 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Tcrg-V1P06325 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Tcrg-V1P06325 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Tcrg-V1P06325 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Tcrg-V1P06325 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Tcrg-V1P06325 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Tcrg-V1P06325 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Tcrg-V1P06325 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Tcrg-V1P06325 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Tcrg-V1P06325 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Tcrg-V1P06325 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Tcrg-V1P06325 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Tcrg-V1P06325 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
Tcrg-V1P06325 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Tcrg-V1P06325 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Tcrg-V1P06325 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Tcrg-V1P06325 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Tcrg-V1P06325 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Tcrg-V1P06325 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Tcrg-V1P06325 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
Tcrg-V1P06325 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,21■■□□□ 1,47
Tcrg-V1P06325 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Tcrg-V1P06325 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,14■■□□□ 1,46
Tcrg-V1P06325 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Tcrg-V1P06325 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Tcrg-V1P06325 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Tcrg-V1P06325 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,02■■□□□ 1,44
Tcrg-V1P06325 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Tcrg-V1P06325 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tcrg-V1P06325 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tcrg-V1P06325 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Tcrg-V1P06325 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Tcrg-V1P06325 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Tcrg-V1P06325 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Tcrg-V1P06325 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Tcrg-V1P06325 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Tcrg-V1P06325 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Tcrg-V1P06325 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Tcrg-V1P06325 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Tcrg-V1P06325 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Tcrg-V1P06325 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Tcrg-V1P06325 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Tcrg-V1P06325 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Tcrg-V1P06325 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Tcrg-V1P06325 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Tcrg-V1P06325 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Tcrg-V1P06325 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Tcrg-V1P06325 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Tcrg-V1P06325 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Tcrg-V1P06325 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Tcrg-V1P06325 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Tcrg-V1P06325 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Tcrg-V1P06325 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Tcrg-V1P06325 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Tcrg-V1P06325 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Tcrg-V1P06325 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,39■■□□□ 1,33
Tcrg-V1P06325 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Tcrg-V1P06325 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Tcrg-V1P06325 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Tcrg-V1P06325 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Tcrg-V1P06325 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
Tcrg-V1P06325 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Tcrg-V1P06325 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Tcrg-V1P06325 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Tcrg-V1P06325 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Tcrg-V1P06325 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Tcrg-V1P06325 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Tcrg-V1P06325 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Tcrg-V1P06325 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Tcrg-V1P06325 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Tcrg-V1P06325 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Tcrg-V1P06325 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Tcrg-V1P06325 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Tcrg-V1P06325 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Tcrg-V1P06325 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,95■■□□□ 1,26
Tcrg-V1P06325 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Tcrg-V1P06325 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,87■■□□□ 1,25
Tcrg-V1P06325 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,4 ms