Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PmchP56942 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PmchP56942 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PmchP56942 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PmchP56942 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PmchP56942 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PmchP56942 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PmchP56942 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PmchP56942 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PmchP56942 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PmchP56942 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PmchP56942 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PmchP56942 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PmchP56942 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PmchP56942 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PmchP56942 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PmchP56942 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PmchP56942 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PmchP56942 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PmchP56942 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PmchP56942 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PmchP56942 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PmchP56942 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PmchP56942 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PmchP56942 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PmchP56942 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PmchP56942 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PmchP56942 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PmchP56942 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PmchP56942 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PmchP56942 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PmchP56942 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PmchP56942 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PmchP56942 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PmchP56942 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PmchP56942 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PmchP56942 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PmchP56942 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PmchP56942 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PmchP56942 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PmchP56942 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PmchP56942 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PmchP56942 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PmchP56942 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PmchP56942 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PmchP56942 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PmchP56942 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PmchP56942 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PmchP56942 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PmchP56942 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PmchP56942 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PmchP56942 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PmchP56942 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PmchP56942 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PmchP56942 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PmchP56942 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PmchP56942 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PmchP56942 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PmchP56942 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PmchP56942 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PmchP56942 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PmchP56942 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PmchP56942 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PmchP56942 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PmchP56942 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmchP56942 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmchP56942 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmchP56942 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PmchP56942 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PmchP56942 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PmchP56942 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PmchP56942 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PmchP56942 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PmchP56942 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmchP56942 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PmchP56942 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PmchP56942 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PmchP56942 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PmchP56942 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmchP56942 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PmchP56942 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PmchP56942 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmchP56942 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PmchP56942 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PmchP56942 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PmchP56942 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PmchP56942 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PmchP56942 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PmchP56942 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PmchP56942 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PmchP56942 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmchP56942 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmchP56942 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PmchP56942 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PmchP56942 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PmchP56942 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PmchP56942 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PmchP56942 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PmchP56942 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PmchP56942 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms