RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000066279.10

Sh3bp4-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp4, Length 4,995 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pilrb2Q2YFS1 225 aa10.83□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Lrcol1Q3URS3 161 aa10.83□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr1535Q7TQU0 326 aa10.83□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 LalbaP29752 143 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ApohQ01339 345 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Wdr81Q5ND34 1934 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ighv5-9A0A075B5Q2 117 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm21900J3QP38 180 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Smim6Q3U0I6 56 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trappc1Q5NCF2 145 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Slc25a47Q6IS41 310 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmem50aQ9CXL1 157 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Josd1Q9DBJ6 202 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ighv1-37A0A0A6YW32 117 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm12355A2A4X6 163 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm27021M0QWE2 156 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Srsf3P84104 164 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmem140Q8BGY5 185 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Spsb4Q8R5B6 273 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 2200002J24RikQ9D807 110 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ighv1-47A0A0A6YY41 117 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 CrxO54751 299 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 MpzP27573 248 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Folr2Q05685 251 aa10.82□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cxcl13O55038 109 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sc5dO88822 299 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mc5rP41149 325 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Prss22Q9ER10 306 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Spg11Q3UHA3 2430 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 SrcapA0A087WQ44 3271 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr1369-ps1A0A140T8K7 317 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm21974F6W3F3 119 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ifitm5O88728 134 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmem170bP86050 132 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trav15-1-dv6-1Q5R1D2 117 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tm2d3Q8BJ83 261 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Opn3Q9WUK7 400 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Adamts9E9PUN6 1931 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Atp5g2P56383 146 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Supt4h1aP63271 117 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Foxr2Q3UM89 302 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dock4P59764 1978 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Exph5Q0VAV2 1960 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Alms1Q8K4E0 3251 aa10.81□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ca11O70354 328 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dynlt3P56387 116 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 YrdcQ3U5F4 280 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Shisa6Q3UH99 525 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 SprnQ8BWU1 147 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr1258Q8VGN6 311 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Vmn1r54Q9EPB8 315 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Med13lQ6JPI3 2207 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tnfrsf9P20334 256 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr1209Q3SXJ3 310 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mbnl2Q8C181 373 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pglyrp3A1A547 347 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Lynx1P0DP60 116 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cdx1P18111 268 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dlx6P70397 175 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cdcp2Q8BQH6 427 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Q91WE4 72 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 CenpvQ9CXS4 252 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Neurog3P70661 214 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 H2-DMb2Q31099 261 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 RprmlQ3URD2 117 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 B020031M17RikQ3UT11 173 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 PgpQ8CHP8 321 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ndufs8Q8K3J1 212 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mrpl16Q99N93 251 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Notch3Q61982 2318 aa10.8□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Igkv13-85A0A075B666 115 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Siah2Q06986 325 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 MavsQ8VCF0 503 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fam213bQ9DB60 201 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Osr1Q9WVG7 266 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rnf144bQ8BKD6 301 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 PtprfA2A8L5 1898 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 UngP97931 306 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr150Q60895 312 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Defa22Q8C1N8 93 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 CrhQ8CIT0 187 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr1404Q8VGE1 313 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zdhhc16Q9ESG8 361 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Vmn1r119E9Q4H3 307 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Atp6v0cP63082 155 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Map1lc3aQ91VR7 121 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tspo2Q9CRZ8 162 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr954Q9EQB6 314 aa10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Phf3B2RQG2 2025 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trav4-2A0A075B638 110 aa10.78□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cpsf4lE9Q2N0 280 aa10.78□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pmis2Q497Q9 96 aa10.78□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 RlfA2A7F4 1918 aa10.78□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm10073E9Q3T0 114 aa10.78□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 P18526 117 aa10.78□□□□□ -0.68
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr1330Q8VEY6 315 aa10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.8 ms