Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Siah2Q06986 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Siah2Q06986 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Siah2Q06986 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Siah2Q06986 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Siah2Q06986 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Siah2Q06986 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Siah2Q06986 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Siah2Q06986 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Siah2Q06986 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Siah2Q06986 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Siah2Q06986 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Siah2Q06986 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Siah2Q06986 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Siah2Q06986 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Siah2Q06986 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Siah2Q06986 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Siah2Q06986 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Siah2Q06986 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah2Q06986 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah2Q06986 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah2Q06986 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah2Q06986 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah2Q06986 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Siah2Q06986 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah2Q06986 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah2Q06986 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah2Q06986 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah2Q06986 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Siah2Q06986 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Siah2Q06986 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Siah2Q06986 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Siah2Q06986 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Siah2Q06986 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Siah2Q06986 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Siah2Q06986 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah2Q06986 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Siah2Q06986 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Siah2Q06986 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Siah2Q06986 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Siah2Q06986 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Siah2Q06986 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Siah2Q06986 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Siah2Q06986 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah2Q06986 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah2Q06986 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Siah2Q06986 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Siah2Q06986 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah2Q06986 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah2Q06986 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah2Q06986 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah2Q06986 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah2Q06986 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Siah2Q06986 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah2Q06986 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah2Q06986 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah2Q06986 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah2Q06986 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah2Q06986 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Siah2Q06986 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Siah2Q06986 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Siah2Q06986 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Siah2Q06986 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Siah2Q06986 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah2Q06986 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah2Q06986 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah2Q06986 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah2Q06986 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah2Q06986 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah2Q06986 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah2Q06986 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah2Q06986 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah2Q06986 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah2Q06986 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah2Q06986 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah2Q06986 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah2Q06986 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Siah2Q06986 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah2Q06986 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah2Q06986 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah2Q06986 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah2Q06986 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah2Q06986 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Siah2Q06986 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah2Q06986 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah2Q06986 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah2Q06986 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah2Q06986 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah2Q06986 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah2Q06986 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah2Q06986 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah2Q06986 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah2Q06986 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah2Q06986 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah2Q06986 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah2Q06986 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah2Q06986 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah2Q06986 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah2Q06986 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah2Q06986 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms