Protein–RNA interactions for Protein: Q6JPI3

Med13l, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13lQ6JPI3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Med13lQ6JPI3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Med13lQ6JPI3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Med13lQ6JPI3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Med13lQ6JPI3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Med13lQ6JPI3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Med13lQ6JPI3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Med13lQ6JPI3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Med13lQ6JPI3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Med13lQ6JPI3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Med13lQ6JPI3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Med13lQ6JPI3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Med13lQ6JPI3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Med13lQ6JPI3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Med13lQ6JPI3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Med13lQ6JPI3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Med13lQ6JPI3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Med13lQ6JPI3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Med13lQ6JPI3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Med13lQ6JPI3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Med13lQ6JPI3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Med13lQ6JPI3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Med13lQ6JPI3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Med13lQ6JPI3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Med13lQ6JPI3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Med13lQ6JPI3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Med13lQ6JPI3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Med13lQ6JPI3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Med13lQ6JPI3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Med13lQ6JPI3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Med13lQ6JPI3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Med13lQ6JPI3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Med13lQ6JPI3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Med13lQ6JPI3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Med13lQ6JPI3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Med13lQ6JPI3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Med13lQ6JPI3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Med13lQ6JPI3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Med13lQ6JPI3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Med13lQ6JPI3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Med13lQ6JPI3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Med13lQ6JPI3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Med13lQ6JPI3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Med13lQ6JPI3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Med13lQ6JPI3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Med13lQ6JPI3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Med13lQ6JPI3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Med13lQ6JPI3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Med13lQ6JPI3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Med13lQ6JPI3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Med13lQ6JPI3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Med13lQ6JPI3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Med13lQ6JPI3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Med13lQ6JPI3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Med13lQ6JPI3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Med13lQ6JPI3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Med13lQ6JPI3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Med13lQ6JPI3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Med13lQ6JPI3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Med13lQ6JPI3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Med13lQ6JPI3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Med13lQ6JPI3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Med13lQ6JPI3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Med13lQ6JPI3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Med13lQ6JPI3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Med13lQ6JPI3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Med13lQ6JPI3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Med13lQ6JPI3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Med13lQ6JPI3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Med13lQ6JPI3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Med13lQ6JPI3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Med13lQ6JPI3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Med13lQ6JPI3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Med13lQ6JPI3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Med13lQ6JPI3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Med13lQ6JPI3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Med13lQ6JPI3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Med13lQ6JPI3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Med13lQ6JPI3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Med13lQ6JPI3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Med13lQ6JPI3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Med13lQ6JPI3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Med13lQ6JPI3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Med13lQ6JPI3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Med13lQ6JPI3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med13lQ6JPI3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med13lQ6JPI3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Med13lQ6JPI3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med13lQ6JPI3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med13lQ6JPI3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med13lQ6JPI3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med13lQ6JPI3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Med13lQ6JPI3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med13lQ6JPI3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med13lQ6JPI3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Med13lQ6JPI3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Med13lQ6JPI3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Med13lQ6JPI3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Med13lQ6JPI3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Med13lQ6JPI3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms