Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
YrdcQ3U5F4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
YrdcQ3U5F4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
YrdcQ3U5F4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
YrdcQ3U5F4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
YrdcQ3U5F4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
YrdcQ3U5F4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
YrdcQ3U5F4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
YrdcQ3U5F4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
YrdcQ3U5F4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
YrdcQ3U5F4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
YrdcQ3U5F4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
YrdcQ3U5F4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
YrdcQ3U5F4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
YrdcQ3U5F4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
YrdcQ3U5F4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
YrdcQ3U5F4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
YrdcQ3U5F4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
YrdcQ3U5F4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,68■■□□□ 1,7
YrdcQ3U5F4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
YrdcQ3U5F4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
YrdcQ3U5F4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
YrdcQ3U5F4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
YrdcQ3U5F4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
YrdcQ3U5F4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
YrdcQ3U5F4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
YrdcQ3U5F4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
YrdcQ3U5F4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
YrdcQ3U5F4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,26■■□□□ 1,63
YrdcQ3U5F4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
YrdcQ3U5F4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
YrdcQ3U5F4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
YrdcQ3U5F4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
YrdcQ3U5F4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
YrdcQ3U5F4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,99■■□□□ 1,59
YrdcQ3U5F4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,96■■□□□ 1,59
YrdcQ3U5F4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
YrdcQ3U5F4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
YrdcQ3U5F4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
YrdcQ3U5F4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
YrdcQ3U5F4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
YrdcQ3U5F4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,52
YrdcQ3U5F4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
YrdcQ3U5F4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,54■■□□□ 1,52
YrdcQ3U5F4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
YrdcQ3U5F4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,45■■□□□ 1,5
YrdcQ3U5F4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
YrdcQ3U5F4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
YrdcQ3U5F4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
YrdcQ3U5F4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,3■■□□□ 1,48
YrdcQ3U5F4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
YrdcQ3U5F4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
YrdcQ3U5F4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
YrdcQ3U5F4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,2■■□□□ 1,46
YrdcQ3U5F4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
YrdcQ3U5F4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
YrdcQ3U5F4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
YrdcQ3U5F4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
YrdcQ3U5F4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
YrdcQ3U5F4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
YrdcQ3U5F4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
YrdcQ3U5F4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
YrdcQ3U5F4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
YrdcQ3U5F4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
YrdcQ3U5F4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
YrdcQ3U5F4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
YrdcQ3U5F4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
YrdcQ3U5F4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,85■■□□□ 1,41
YrdcQ3U5F4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
YrdcQ3U5F4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
YrdcQ3U5F4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
YrdcQ3U5F4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
YrdcQ3U5F4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
YrdcQ3U5F4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
YrdcQ3U5F4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
YrdcQ3U5F4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
YrdcQ3U5F4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
YrdcQ3U5F4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
YrdcQ3U5F4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
YrdcQ3U5F4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
YrdcQ3U5F4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,61■■□□□ 1,37
YrdcQ3U5F4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
YrdcQ3U5F4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
YrdcQ3U5F4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
YrdcQ3U5F4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
YrdcQ3U5F4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
YrdcQ3U5F4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,48■■□□□ 1,35
YrdcQ3U5F4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
YrdcQ3U5F4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
YrdcQ3U5F4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
YrdcQ3U5F4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
YrdcQ3U5F4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
YrdcQ3U5F4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,32
YrdcQ3U5F4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
YrdcQ3U5F4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
YrdcQ3U5F4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,3■■□□□ 1,32
YrdcQ3U5F4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
YrdcQ3U5F4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
YrdcQ3U5F4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,24■■□□□ 1,31
YrdcQ3U5F4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms