Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4H3

Vmn1r119, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r119E9Q4H3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Vmn1r119E9Q4H3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r119E9Q4H3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r119E9Q4H3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn1r119E9Q4H3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r119E9Q4H3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r119E9Q4H3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r119E9Q4H3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r119E9Q4H3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r119E9Q4H3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r119E9Q4H3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r119E9Q4H3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r119E9Q4H3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r119E9Q4H3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r119E9Q4H3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r119E9Q4H3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r119E9Q4H3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r119E9Q4H3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r119E9Q4H3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r119E9Q4H3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r119E9Q4H3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r119E9Q4H3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r119E9Q4H3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r119E9Q4H3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r119E9Q4H3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r119E9Q4H3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r119E9Q4H3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r119E9Q4H3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r119E9Q4H3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r119E9Q4H3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r119E9Q4H3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r119E9Q4H3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r119E9Q4H3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r119E9Q4H3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r119E9Q4H3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r119E9Q4H3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r119E9Q4H3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r119E9Q4H3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r119E9Q4H3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r119E9Q4H3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r119E9Q4H3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r119E9Q4H3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r119E9Q4H3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r119E9Q4H3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r119E9Q4H3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r119E9Q4H3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r119E9Q4H3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r119E9Q4H3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r119E9Q4H3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r119E9Q4H3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r119E9Q4H3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r119E9Q4H3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r119E9Q4H3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r119E9Q4H3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r119E9Q4H3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r119E9Q4H3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r119E9Q4H3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r119E9Q4H3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r119E9Q4H3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r119E9Q4H3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r119E9Q4H3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r119E9Q4H3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r119E9Q4H3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r119E9Q4H3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r119E9Q4H3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r119E9Q4H3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r119E9Q4H3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r119E9Q4H3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r119E9Q4H3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r119E9Q4H3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r119E9Q4H3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r119E9Q4H3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r119E9Q4H3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r119E9Q4H3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r119E9Q4H3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r119E9Q4H3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r119E9Q4H3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r119E9Q4H3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r119E9Q4H3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r119E9Q4H3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r119E9Q4H3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r119E9Q4H3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r119E9Q4H3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r119E9Q4H3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r119E9Q4H3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r119E9Q4H3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r119E9Q4H3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r119E9Q4H3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r119E9Q4H3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r119E9Q4H3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r119E9Q4H3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r119E9Q4H3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r119E9Q4H3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r119E9Q4H3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r119E9Q4H3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r119E9Q4H3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r119E9Q4H3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r119E9Q4H3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r119E9Q4H3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r119E9Q4H3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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