RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	CKA1	P15790	372 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	MNE1	P24720	663 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SRL3	P36167	246 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	APM3	P38153	483 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	TDA11	P38854	504 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SPC72	P39723	622 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YIL165C	P40446	119 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	MAD3	P47074	515 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	HNT2	P49775	206 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SHE10	P53075	577 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ATP25	Q03153	612 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	VPS38	Q05919	439 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	VID22	Q05934	901 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SWA2	Q06677	668 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ISA2	Q12425	185 aa		5.77	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.76	□□□□□ -1.49	not detected
UBX2	YML013W	REC107	P21651	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	MDL1	P33310	695 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	CNS1	P33313	385 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ERT1	P38140	529 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SAW1	P39735	261 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	RTT105	P40063	208 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	PCL7	P40186	285 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YTA6	P40328	754 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	STB1	P42845	420 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	MDE1	P47095	244 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	FMS1	P50264	508 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ALF1	P53904	254 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	VPS9	P54787	451 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	FCP1	Q03254	732 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	NHX1	Q04121	633 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	RNH1	Q04740	348 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ATG26	Q06321	1198 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	VHS3	Q08438	674 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	TMA16	Q08687	178 aa		5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.76	□□□□□ -1.49	not detected
UBX2	YML013W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	FAR1	P21268	830 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	APN1	P22936	367 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	PER1	P25625	357 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	UGA3	P26370	528 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SLA1	P32790	1244 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	RIB7	P33312	244 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	BUD2	P33314	1104 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	EXO5	P38289	585 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	FTH1	P38310	465 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YBR225W	P38321	900 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	BUD16	P39988	312 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	TOK1	P40310	691 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YJL068C	P40363	299 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	PXA1	P41909	870 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	DAM1	P53267	343 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YNL144C	P53907	740 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	RAD33	Q04231	177 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	MGR3	Q04472	501 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YPR172W	Q06608	200 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	HFI1	Q12060	488 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	DCS2	Q12123	353 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	OCA6	Q12454	224 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	MTF2	P10849	440 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YCL049C	P25577	312 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ERG3	P32353	365 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YKL077W	P36081	392 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YLF2	P38746	405 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	DUN1	P39009	513 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	UBP7	P40453	1071 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	POL31	P46957	487 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SAP4	P53036	818 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ZDS2	P54786	942 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YLH47	Q06493	454 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	YDL073W	Q07454	984 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ELG1	Q12050	791 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	IES3	Q12345	250 aa		5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	PHO13	P19881	312 aa		5.74	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	PHO3	P24031	467 aa		5.74	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	REC104	P33323	182 aa		5.74	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ADD66	P36040	267 aa		5.74	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ATG14	P38270	344 aa		5.74	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SMF1	P38925	575 aa		5.74	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
UBX2	YML013W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected

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