RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W APE1P14904 514 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W MCM3P24279 971 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RPD3P32561 433 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YBR284WP38150 797 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YHR078WP38799 552 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W NUP82P40368 713 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W MOB1P40484 314 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W BUD6P41697 788 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W NIT3P49954 291 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RNH70P53331 553 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ASI2P53895 289 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RNT1Q02555 471 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SWM1Q12379 170 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RRD2Q12461 358 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SNF1P06782 633 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W TOM70P07213 617 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ERR1P0CX10 437 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ERR2P0CX11 437 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W COQ1P18900 473 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ADK2P26364 225 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W DRE2P36152 348 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W VPS8P39702 1274 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W BUD16P39988 312 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W CEP3P40969 608 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RTA1P53047 317 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W LIF1P53150 421 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W FOL1P53848 824 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W MUK1Q02866 612 aa2.53□□□□□ -2
SSQ1YLR369W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W NUC1P08466 329 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PHO8P11491 566 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W TOP3P13099 656 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MSS51P32335 436 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YIR016WP40572 265 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MAF1P41910 395 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YGL242CP53066 181 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W DAM1P53267 343 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W REH1Q06709 432 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YLR125WQ12138 136 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MSB2P32334 1306 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MET3P08536 511 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W DAL5P15365 543 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SUI2P20459 304 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PEX1P24004 1043 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W BET3P36149 193 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SUL1P38359 859 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W VPS45P38932 577 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W FMS1P50264 508 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PUS2P53167 370 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PIB2P53191 635 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ALG12P53730 551 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ATP25Q03153 612 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W THI21Q08975 551 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W HAL9Q12180 1030 aa2.52□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ALG7P07286 448 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PRP4P20053 465 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W CYS3P31373 394 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W THI4P32318 326 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W GCS1P35197 352 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RRP14P36080 434 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SIC1P38634 284 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RIM4P38741 713 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W FPR3P38911 411 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PES4P39684 611 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ELO3P40319 345 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W GYP8P43570 497 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ALG2P43636 503 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ZAP1P47043 880 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W TIM44Q01852 431 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W DLT1Q04216 342 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YML053CQ04978 212 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ACF2Q12168 779 aa2.51□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MET6P05694 767 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SRP54P20424 541 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RIT1P23796 513 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RME1P32338 300 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W NGG1P32494 702 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MYO3P36006 1272 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MRPL7P36519 292 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RFC1P38630 861 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RPP1P38786 293 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MMF1P40185 145 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W QRI1P43123 477 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MCH5Q08777 521 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W TRM13Q12383 476 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W UBC1P21734 215 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W DAL7P21826 554 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PDR3P33200 976 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W COY1P34237 679 aa2.5□□□□□ -2.01
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