RNA–Protein interactions for RNA: YLR248W

RCK2, Transcript of Protein kinase involved in response to oxidative and osmotic stress, yeast

Gene RCK2, Length 1,833 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCK2	YLR248W	ATG9	Q12142	997 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK2	YLR248W	TUS1	Q06412	1307 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RCK2	YLR248W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	SPO11	P23179	398 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YBL028C	P38202	106 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CST26	P38226	397 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	SEC9	P40357	651 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	NIT1	P40447	199 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	VTC2	P43585	828 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	VPS60	Q03390	229 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CSM3	Q04659	317 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	VPS38	Q05919	439 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	FOB1	O13329	566 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	TRP3	P00937	484 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	PET111	P08468	800 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	PLC1	P32383	869 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	KAE1	P36132	386 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	TCD1	P38756	429 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	NDT80	P38830	627 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	SHC1	P39000	512 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	PES4	P39684	611 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	VPS4	P52917	437 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	ALF1	P53904	254 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	ORC3	P54790	616 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	AIM33	Q04516	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YAP7	Q08182	245 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	HMI1	Q12039	706 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	HAL9	Q12180	1030 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YOR022C	Q12204	715 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	GSC2	P40989	1895 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	LTV1	P34078	463 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YKR051W	P36142	418 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	EFM2	P38347	419 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	GAA1	P39012	614 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CAJ1	P39101	391 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YEL076C	P39971	216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YGR012W	P53206	393 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CBK1	P53894	756 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YLR287C	Q05881	355 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YLR149C	Q99296	730 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	SPO12	P17123	173 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CKA2	P19454	339 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	DAL3	P32459	195 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YKR073C	P36153	106 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	VFA1	P40080	203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	NIT2	P47016	307 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YNL034W	P53963	612 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YNL018C	P53976	612 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	ERG5	P54781	538 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	ECM9	Q02202	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	SND1	Q04007	877 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CRF1	Q04930	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YLH47	Q06493	454 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	YOR378W	Q08902	515 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	SMC6	Q12749	1114 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	CYC7	P00045	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	MTF2	P10849	440 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	HSF1	P10961	833 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	OM45	P16547	393 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	MSM1	P22438	575 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	SEC6	P32844	805 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	PPS1	P38148	807 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	HSL7	P38274	827 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	SUL1	P38359	859 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	LSB1	P53281	241 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	TRE2	Q08693	809 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	DIF1	O13577	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	STE11	P23561	717 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	TFC4	P33339	1025 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	HXT7	P39004	570 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RCK2	YLR248W	NDC80	P40460	691 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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