RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	SWE1	P32944	819 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	CNS1	P33313	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	BYE1	P36106	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SMF1	P38925	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SIT1	P39980	628 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	YJR079W	P47126	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	PUS2	P53167	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	NGL3	Q03210	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	TFC6	Q06339	672 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	OPI10	Q08202	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	SGO1	Q08490	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	NUR1	Q12066	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TVP38	YKR088C	MTF2	P10849	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SPO12	P17123	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	CKI1	P20485	582 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	GRX7	P38068	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RXT2	P38255	430 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SPT8	P38915	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PCI8	P40512	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YIR042C	P40586	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	LYS14	P40971	790 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	ASI2	P53895	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	IRC13	Q08630	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	ALG1	P16661	449 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	DAL7	P21826	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SRB4	P32569	687 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MYO3	P36006	1272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MAL31	P38156	614 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SIC1	P38634	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	VFA1	P40080	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	STE23	Q06010	1027 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	CEX1	Q12453	761 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	CYB2	P00175	591 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	CDC8	P00572	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RAD1	P06777	1100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	CLN2	P20438	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	HXT1	P32465	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	ANP1	P32629	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SWH1	P35845	1188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YSW1	P38280	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	TDA3	P38758	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	UME1	Q03010	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	VPS72	Q03388	795 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	ENT1	Q12518	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PSO2	P30620	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	ERG7	P38604	731 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PZF1	P39933	429 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	VAC8	P39968	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	CSM2	P40465	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PXA1	P41909	870 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	TRS85	P46944	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YGL138C	P53122	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	NRG1	Q03125	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	INM2	Q05533	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PSR2	Q07949	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	TIP41	Q12199	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	TOP1	P04786	769 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MAK31	P23059	88 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	FMP52	P40008	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	IES1	P43579	692 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RTC4	P53850	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SOV1	Q04748	898 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	THI3	Q07471	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.5 ms