RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	EAF5	P39995	279 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	PRM2	P40534	656 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	IRC5	P43610	853 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	OMS1	Q06668	471 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	VMR1	P38735	1592 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	NIC96	P34077	839 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	YHL017W	P38745	532 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	RFX1	P48743	811 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	FHN1	P53279	174 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	CAT8	P39113	1433 aa		5	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	ATP4	P05626	244 aa		5	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	PCL5	P38794	229 aa		5	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	MPS3	P47069	682 aa		5	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	SSL2	Q00578	843 aa		5	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	MUK1	Q02866	612 aa		5	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	ACF2	Q12168	779 aa		5	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	NYV1	Q12255	253 aa		5	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
MTD1	YKR080W	STL1	P39932	569 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	TIM44	Q01852	431 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	AIM41	Q12032	185 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	MLH3	Q12083	715 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	USV1	Q12132	391 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	VPS5	Q92331	675 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	HMG2	P12684	1045 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	TUP1	P16649	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	NTH1	P32356	751 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	MTC7	P32633	139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	FTR1	P40088	404 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	YIL092W	P40497	633 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	RTS3	P53289	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	NUR1	Q12066	484 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	ABF1	P14164	731 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	PHO3	P24031	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	KCC4	P25389	1037 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	YKL133C	P36066	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	CTP1	P38152	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	CDS1	P38221	457 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	TMN3	P40071	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	TPM2	P40414	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	PEF1	P53238	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	CTF4	Q01454	927 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	MET14	Q02196	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	FDC1	Q03034	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	HLR1	Q04429	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	MCH5	Q08777	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	PSF3	Q12146	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	PNS1	Q12412	539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	SAW1	P39735	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	STB4	P50104	949 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	MNT2	P53059	558 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	SLI1	P53304	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	TIM50	Q02776	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	BNR1	P40450	1375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	GAL1	P04385	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	CWH43	P25618	953 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	FUB1	P25659	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	MOH1	P38191	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	KHA1	P40309	873 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	ARG2	P40360	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	NDC80	P40460	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	ATG36	P46983	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	YDL183C	P48569	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	PIP2	P52960	996 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	YGR151C	P53287	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	ATG4	P53867	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	HOP1	P20050	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	PTP2	P29461	750 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	OAR1	P35731	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	SDS22	P36047	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	SET3	P36124	751 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	EHT1	P38295	451 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	TAH11	P47112	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	ASK10	P48361	1146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	CTR1	P49573	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	MDR1	P53258	950 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	MLC2	Q06580	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	IZH3	Q07959	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.3 ms