RNA–Protein interactions for RNA: YJR048W

CYC1, Transcript of Cytochrome c, isoform 1, yeast

Gene CYC1, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYC1	YJR048W	CBF2	P32504	956 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SLA2	P33338	968 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YHR202W	P38887	602 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	VPS41	P38959	992 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	UME6	P39001	836 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	RTT105	P40063	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PUG1	P40100	303 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PSF2	P40359	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ALY2	P47029	1046 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MDE1	P47095	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MSE1	P48525	536 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CTF18	P49956	741 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	HFM1	P51979	1187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	NNF2	P53253	936 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SLI1	P53304	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SUN4	P53616	420 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	HST1	P53685	503 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	TRM8	Q12009	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	NTO1	Q12311	748 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	GCN4	P03069	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CBP3	P21560	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	APN1	P22936	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ROX1	P25042	368 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	POL4	P25615	582 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PUP2	P32379	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	RIB7	P33312	244 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	TGL1	P34163	548 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	RRT14	P40470	206 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	LYS14	P40971	790 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	RAD33	Q04231	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	RNH1	Q04740	348 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SWA2	Q06677	668 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
CYC1	YJR048W	NFI1	Q12216	726 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	RTN2	Q12443	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PHO5	P00635	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ADH4	P10127	382 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	GPI10	P30777	616 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	IFA38	P38286	347 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PLB1	P39105	664 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SWD1	P39706	426 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	STL1	P39932	569 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	EAF5	P39995	279 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	LTP1	P40347	161 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	HXT16	P47185	567 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MTC3	P53077	123 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YNR061C	P53747	219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YML119W	Q03208	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	GIS1	Q03833	894 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SNO4	Q04902	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ARP9	Q05123	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MCH5	Q08777	521 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	HSP32	Q08992	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CLB4	P24871	460 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ESL2	P36168	1195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MND2	P40577	368 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YJL055W	P47044	245 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SHE10	P53075	577 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SFB2	P53953	876 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	TPO1	Q07824	586 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MLH2	Q07980	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	XYL2	Q07993	356 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	APL4	Q12028	832 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	HSF1	P10961	833 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	STE50	P25344	346 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	DAL80	P26343	269 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	DCG1	P32460	244 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	TFB1	P32776	642 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	STE13	P33894	931 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	UIP5	P36137	443 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	MRPL36	P36531	177 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	TAF5	P38129	798 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CYC1	YJR048W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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