RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeastyeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM54YJL054W COG4Q06096 861 aa5.76□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W NSE1Q07913 336 aa5.76□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W SLX4Q12098 748 aa5.76□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W MTF1P14908 341 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W RNR1P21524 888 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TAT1P38085 619 aa5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W SIF2P38262 535 aa5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W HER2Q03557 464 aa5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W WAR1Q03631 944 aa5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YOL075CQ08234 1294 aa5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W GPA1P08539 472 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W CYC8P14922 966 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W CDC42P19073 191 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W COX11P19516 300 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W MSH3P25336 1018 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W RRT12P25381 491 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YKR051WP36142 418 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W POL12P38121 705 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W DUG2P38149 878 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W GEM1P39722 662 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YER130CP39959 443 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W DSE1P40077 573 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YJR054WP47114 497 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W COS5P47187 383 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YGR237CP50089 785 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W UTP8P53276 713 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YPL109CQ02981 657 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W MUB1Q03162 620 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W PRM6Q04705 352 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YPQ1Q12010 308 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W STE11P23561 717 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W HCM1P25364 564 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W PSO2P30620 661 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W RAD16P31244 790 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W EFB1P32471 206 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W SEG2P34250 1132 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YBR056WP38081 501 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W CPR7P47103 393 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YHM2Q04013 314 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W BSP1Q06604 576 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YIG1Q08956 461 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W AFT2Q08957 416 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W MCD1Q12158 566 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YDR215CQ12240 137 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W NDJ1Q12366 352 aa5.74□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TRP2P00899 507 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YCK2P23292 546 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W PPH22P23595 377 aa5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W CBF2P32504 956 aa5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W REI1P38344 393 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W NEM1P38757 446 aa5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W IES1P43579 692 aa5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W AIP1P46680 615 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W PPM1Q04081 328 aa5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YLL054CQ12244 843 aa5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W MPD2Q99316 277 aa5.73□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W LAA1P39526 2014 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TY1A-DR6P0CX70 440 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TY1A-ER1P0CX71 440 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TY1A-LR2P0CX72 440 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TY1A-PLP0CX73 440 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TY1A-JR1P0CX74 440 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TY1A-LR3P0CX75 440 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W TY1A-ML2P0CX76 440 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W VBA3P25594 458 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W RSC6P25632 483 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W APL1P27351 700 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W KIP1P28742 1111 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W VBA5P36172 582 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W NOP4P37838 685 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W ATG14P38270 344 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W YBR225WP38321 900 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W FMO1P38866 432 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W NUP60P39705 539 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W SLS1P42900 643 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W CIR1P42940 261 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W GYP8P43570 497 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W LSB3P43603 459 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W ZAP1P47043 880 aa5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W IMP4P53941 290 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TIM54YJL054W GCN5Q03330 439 aa5.72□□□□□ -1.49
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