RNA–Protein interactions for RNA: YGR135W

PRE9, Transcript of Alpha 3 subunit of the 20S proteasome, yeast

Gene PRE9, Length 777 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRE9	YGR135W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	CDC15	P27636	974 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	YKR075C	P36155	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	PXL1	P36166	706 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	RFC5	P38251	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	VID28	P40547	921 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	MAL13	P53338	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	VPS75	P53853	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	ARP5	P53946	755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	OMS1	Q06668	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	TMA16	Q08687	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	OSW2	Q12202	724 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
PRE9	YGR135W	ENT1	Q12518	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	APM4	Q99186	491 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SWI1	P09547	1314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	ATP12	P22135	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	PHO3	P24031	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SWH1	P35845	1188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	RRN3	P36070	627 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	NUP133	P36161	1157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	ESL1	P40456	1118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	MTC3	P53077	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	PUS2	P53167	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	PIB2	P53191	635 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	ZDS2	P54786	942 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	RBA50	Q04418	439 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	RSB1	Q08417	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SNF5	P18480	905 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	PHO13	P19881	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	HOP1	P20050	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	RPO26	P20435	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SWI3	P32591	825 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SLC1	P33333	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SDS22	P36047	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	POA1	P38218	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	CCZ1	P38273	704 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	CAJ1	P39101	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SMK1	P41808	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	MRPL22	P53881	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	ATG9	Q12142	997 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	RPC82	P32349	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	IMP2'	P32351	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	YEL043W	P32618	956 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	AIM26	P32858	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	APM3	P38153	483 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	EAF5	P39995	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SEC9	P40357	651 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	NDC80	P40460	691 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	VTC2	P43585	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	VPS4	P52917	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	ALF1	P53904	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	BOP3	P53958	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	HDA1	P53973	706 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	HLR1	Q04429	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	CIA1	Q05583	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SFH1	Q06168	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	ATG23	Q06671	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	ESC8	Q08119	714 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	MCH5	Q08777	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	ARP7	Q12406	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SEC39	Q12745	709 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	NUC1	P08466	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	OPI1	P21957	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SAN1	P22470	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	YCR015C	P25616	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	NGG1	P32494	702 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	TOA1	P32773	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	YKR018C	P36114	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	FLR1	P38124	548 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRE9	YGR135W	PIK1	P39104	1066 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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